奇怪的行为 awk 最后一个字符“]”

Question

我在尝试对文件中的某些列进行括号化时遇到了奇怪的 awk 行为：

batch ID        tumor_reads2_fastqgzs   tumor_reads_fastqgzs    tumor_reads2_fastqgzs ID        tumor_reads_fastqgzs ID
9_S8    9_S8_L001_R2_001.fastq.gz       9_S8_L001_R1_001.fastq.gz       file-Fk3BgVj4yBGZqQvF2VV2Q2Z4   file-Fk3BgfQ4yBGYz756BGvbzkP8
7_S6    7_S6_L001_R2_001.fastq.gz       7_S6_L001_R1_001.fastq.gz       file-Fk3Bg884yBGYF4xXJjpf08f8   file-Fk3Bg1j4yBGvbp9VK2ZQ76G3
10_S9   10_S9_L001_R2_001.fastq.gz      10_S9_L001_R1_001.fastq.gz      file-Fk3Bfg84yBGq9g7zJk5kv435   file-Fk3BfVQ4yBGxxPZy6pjxv635
3_S3    3_S3_L001_R2_001.fastq.gz       3_S3_L001_R1_001.fastq.gz       file-Fk3Bf3Q4yBGq9g7zJk5kv42z   file-Fk3BfB04yBGYz756BGvbzkGk
15_S14  15_S14_L001_R2_001.fastq.gz     15_S14_L001_R1_001.fastq.gz     file-Fk3Bbp04yBGkyPqy2073BKf7   file-Fk3BbV84yBGq00fKK3j5KjG5

这是我的文件，我想将第 4 列和第 5 列括起来，所以：

awk -v OFS="\t" '{if([=11=] ~ /^batch/){print [=11=]}else{print , , , "[""]", "[""]";}}' myfile

但是它输出了这个：

batch ID        tumor_reads2_fastqgzs   tumor_reads_fastqgzs    tumor_reads2_fastqgzs ID        tumor_reads_fastqgzs ID
]_S8    9_S8_L001_R2_001.fastq.gz       9_S8_L001_R1_001.fastq.gz       [file-Fk3BgVj4yBGZqQvF2VV2Q2Z4] [file-Fk3BgfQ4yBGYz756BGvbzkP8
]_S6    7_S6_L001_R2_001.fastq.gz       7_S6_L001_R1_001.fastq.gz       [file-Fk3Bg884yBGYF4xXJjpf08f8] [file-Fk3Bg1j4yBGvbp9VK2ZQ76G3
]0_S9   10_S9_L001_R2_001.fastq.gz      10_S9_L001_R1_001.fastq.gz      [file-Fk3Bfg84yBGq9g7zJk5kv435] [file-Fk3BfVQ4yBGxxPZy6pjxv635
]_S3    3_S3_L001_R2_001.fastq.gz       3_S3_L001_R1_001.fastq.gz       [file-Fk3Bf3Q4yBGq9g7zJk5kv42z] [file-Fk3BfB04yBGYz756BGvbzkGk
]5_S14  15_S14_L001_R2_001.fastq.gz     15_S14_L001_R1_001.fastq.gz     [file-Fk3Bbp04yBGkyPqy2073BKf7] [file-Fk3BbV84yBGq00fKK3j5KjG5

由于某种原因，最后一个括号替换了第一个字符。知道为什么吗？我该如何解决？我也尝试使用 sub() 但它做了同样的事情

Answer 1

你的代码对我有用。恕我直言，您的 Input_file 中有可能包含控制 M 字符，因此您可以添加一段代码来删除它们，能否请您尝试以下操作。

awk -v OFS="\t" '{gsub(/\r/,"");if([=10=] ~ /^batch/){print [=10=]}else{print , , , "[""]", "[""]";}}' Input_file

奇怪的行为 awk 最后一个字符“]”

Weird behaviour awk last character "]"

awk

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