使用组信息制作邻接矩阵
Making adjacency matrix using group information
我对 R 比较陌生，在使用组特征创建邻接矩阵时遇到问题。
我有一个如下所示的数据框：
distid villageid hhid group1 group2 group3 group4
1 1 111 0 1 0 0
1 1 112 1 1 1 0
1 2 121 1 1 0 1
1 2 122 1 0 0 1
2 1 211 1 1 0 0
2 1 212 1 1 1 1
2 2 221 0 0 1 0
2 2 222 0 1 1 0
我需要创建一个邻接矩阵，如果 hhid 在同一个 distid、villageid 和组中，那么它们都是完全连接的。
所以我的最终矩阵应该是这样的
hhid 111 112 121 122 211 212 221 222
111 0 1 0 0 0 0 0 0
112 1 0 0 0 0 0 0 0
121 0 0 0 1 0 0 0 0
122 0 0 0 0 0 0 0 0
211 0 0 0 0 0 1 0 0
212 0 0 0 0 1 0 0 0
221 0 0 0 0 0 0 0 1
222 0 0 0 0 0 0 1 0
我们假设想要的是，如果两个元素在同一个组dist和village中，则认为它们是相邻的。
使用注释中的输入为组、distid 和 villageid 创建邻接矩阵，然后将它们相乘并将对角线归零。
m1 <- sign(crossprod(t(DF[-(1:3)])))
m2 <- +outer(DF$distid, DF$distid, "==")
m3 <- +outer(DF$villageid, DF$villageid, "==")
m4 <- 1 - diag(nrow(DF))
m <- m1 * m2 * m3 * m4
dimnames(m) <- list(DF$hhid, DF$hhid)
给予：
> m
111 112 121 122 211 212 221 222
111 0 1 0 0 0 0 0 0
112 1 0 0 0 0 0 0 0
121 0 0 0 1 0 0 0 0
122 0 0 1 0 0 0 0 0
211 0 0 0 0 0 1 0 0
212 0 0 0 0 1 0 0 0
221 0 0 0 0 0 0 0 1
222 0 0 0 0 0 0 1 0
图表
library(igraph)
g <- graph_from_adjacency_matrix(m)
plot(g)
备注
可重现形式的输入。
Lines <- "distid villageid hhid group1 group2 group3 group4
1 1 111 0 1 0 0
1 1 112 1 1 1 0
1 2 121 1 1 0 1
1 2 122 1 0 0 1
2 1 211 1 1 0 0
2 1 212 1 1 1 1
2 2 221 0 0 1 0
2 2 222 0 1 1 0"
DF <- read.table(text = Lines, header = TRUE)
我对 R 比较陌生，在使用组特征创建邻接矩阵时遇到问题。
我有一个如下所示的数据框：
distid villageid hhid group1 group2 group3 group4
1 1 111 0 1 0 0
1 1 112 1 1 1 0
1 2 121 1 1 0 1
1 2 122 1 0 0 1
2 1 211 1 1 0 0
2 1 212 1 1 1 1
2 2 221 0 0 1 0
2 2 222 0 1 1 0
我需要创建一个邻接矩阵，如果 hhid 在同一个 distid、villageid 和组中，那么它们都是完全连接的。
所以我的最终矩阵应该是这样的
hhid 111 112 121 122 211 212 221 222
111 0 1 0 0 0 0 0 0
112 1 0 0 0 0 0 0 0
121 0 0 0 1 0 0 0 0
122 0 0 0 0 0 0 0 0
211 0 0 0 0 0 1 0 0
212 0 0 0 0 1 0 0 0
221 0 0 0 0 0 0 0 1
222 0 0 0 0 0 0 1 0
我们假设想要的是，如果两个元素在同一个组dist和village中，则认为它们是相邻的。
使用注释中的输入为组、distid 和 villageid 创建邻接矩阵，然后将它们相乘并将对角线归零。
m1 <- sign(crossprod(t(DF[-(1:3)])))
m2 <- +outer(DF$distid, DF$distid, "==")
m3 <- +outer(DF$villageid, DF$villageid, "==")
m4 <- 1 - diag(nrow(DF))
m <- m1 * m2 * m3 * m4
dimnames(m) <- list(DF$hhid, DF$hhid)
给予：
> m
111 112 121 122 211 212 221 222
111 0 1 0 0 0 0 0 0
112 1 0 0 0 0 0 0 0
121 0 0 0 1 0 0 0 0
122 0 0 1 0 0 0 0 0
211 0 0 0 0 0 1 0 0
212 0 0 0 0 1 0 0 0
221 0 0 0 0 0 0 0 1
222 0 0 0 0 0 0 1 0
图表
library(igraph)
g <- graph_from_adjacency_matrix(m)
plot(g)
备注
可重现形式的输入。
Lines <- "distid villageid hhid group1 group2 group3 group4
1 1 111 0 1 0 0
1 1 112 1 1 1 0
1 2 121 1 1 0 1
1 2 122 1 0 0 1
2 1 211 1 1 0 0
2 1 212 1 1 1 1
2 2 221 0 0 1 0
2 2 222 0 1 1 0"
DF <- read.table(text = Lines, header = TRUE)