在 Perl 中查找和替换字符串
Find and replace a string in Perl
我有以下命令行:
perl -i -pe 's/_GSV*//g' file.fasta
我的目标是改变一些具有以下模式的序列:
GSVIVG01006342001_GSVIVT01006342001
我想找到所有以 _GSV 开头并以任何内容结尾的序列(这就是我放置“*”的原因)并且不替换任何内容。
当我 运行 我的命令时,它只识别 _GSV 并且 return 对我来说:
GSVIVG01006342001IVT01006342001
我想要那个:
GSVIVG01006342001
有人能告诉我我的命令行有什么问题吗?
在 * 之前,包含一个表示任何字符的点
perl -i -pe 's/_GSV.*//g' file.fasta
您还可以包含符号 $ 以确保到达字符串末尾
perl -i -pe 's/_GSV.*$//g' file.fasta
我有以下命令行:
perl -i -pe 's/_GSV*//g' file.fasta
我的目标是改变一些具有以下模式的序列:
GSVIVG01006342001_GSVIVT01006342001
我想找到所有以 _GSV 开头并以任何内容结尾的序列(这就是我放置“*”的原因)并且不替换任何内容。
当我 运行 我的命令时,它只识别 _GSV 并且 return 对我来说:
GSVIVG01006342001IVT01006342001
我想要那个:
GSVIVG01006342001
有人能告诉我我的命令行有什么问题吗?
在 * 之前,包含一个表示任何字符的点
perl -i -pe 's/_GSV.*//g' file.fasta
您还可以包含符号 $ 以确保到达字符串末尾
perl -i -pe 's/_GSV.*$//g' file.fasta