从 ggplot2 中的图例类别中删除 stat_summary 个符号

Question

我有以下代码创建了两个小提琴图：

ggplot(both,aes(x=levelsname,y=loginc,fill=levelsname))+
geom_violin() +
  stat_summary(fun.y = mean,
               aes(shape="Mean"),
               colour='black',
               geom="point",
               size=3)+
    scale_shape_manual("Summary Statistics", values=c("Mean"="+"))+  
  scale_fill_manual(values=c('gray70','orange','red'))+
  scale_x_discrete(name="Site Category")+
  scale_y_continuous(name = "Log(Incidence/100,000")+
  guides(fill=guide_legend(title = "Site Category"))+
  facet_grid(~ANA)+
  theme_classic()+
  theme(axis.text.x=element_blank())

除了传说之外，这些情节的一切都是正确的。我试图从站点类别下的图例中删除黑色圆圈，并将其替换为 + 符号。我还想移动站点类别图例项下方的 + 和表示图例符号，使其看起来像一个图例。

Answer 1

您不应该在 aes 调用中包含 shape="Mean"。这不是美学映射！将它放在 aes 中会使 ggplot 认为您正在设置 shape 以映射到始终采用值 "mean" 的字符变量。于是就有了诡异的传说。

您可以只使用 shape="+" 作为 stat_summary 调用中的参数来获得您想要的效果。您可能还需要删除 scale_shape_manual("Summary Statistics", values=c("Mean"="+")) 行，因为不再有形状比例。

要回答你问题的最后一部分，如果你想为你的图例添加一个单独的 "mean" 行，你可以添加一个额外的级别 "Mean" 到映射到 fill 美学的变量（然后手动将其填充设置为透明）。见下文：

d <- data.frame(x=factor(c(1,2)), y=rnorm(100))

ggplot(d, aes(x,y, group=x, fill=x)) + 
   geom_violin() + 
   stat_summary(shape="+", fun="mean", aes(fill="Mean"), geom="point", size=3) +
   scale_fill_manual(values=c("blue", "red", "#00000000"), limits=c(1,2,"Mean"))

编辑： 我找到了一种方法来去掉图例中线中 + 周围的框，但这是一个可怕的技巧。您需要两个 stat_summary 图层，其中一个图层 color 设置为具有美学映射的透明（因此图例框是透明的，但这也使图例“+”也透明），然后第二个 color="black" 直接替换图例中的“+”而不是方框。

ggplot(d, aes(x,y, group=x, fill=x, color=x)) + 
   geom_violin() + 
   stat_summary(shape="+", fun="mean", aes(fill="Mean",color="Mean"), geom="point", size=3)+
   stat_summary(shape="+", fun="mean",color="black", geom="point", size=3) +
   theme_classic() + 
   scale_fill_manual(values=c("lightblue", "red", "#00000000"), limits=c(1,2,"Mean"))+  
   scale_color_manual(values=c("black", "black", "#00000000"), limits=c(1,2,"Mean"))

从 ggplot2 中的图例类别中删除 stat_summary 个符号

Removing stat_summary symbols from legend categories in ggplot2

r

ggplot2

violin-plot