pymatgen 的命令行工具

Question

我已经安装了 python 包 pymatgen，当我在我的 Jupyter 笔记本中使用它时，它完美地工作。但是，现在我想按照此处指定的方式进行 POSCAR 设置：https://pymatgen.org/installation.html 但是当我在我的命令行 (Linux) 中运行: pmg config -p <EXTRACTED_VASP_POTCAR> <MY_PSP> (with my directories) 时，它找不到它并且我得到错误：

Command 'pmg' not found, did you mean:

  command 'mg' from deb mg
  command 'pmc' from deb linuxptp
  command 'pig' from deb bsdgames
  command 'pmi' from deb powermanagement-interface
  command 'pmw' from deb pmw
  command 'vmg' from deb vmg
  command 'pms' from deb pms
  command 'pm' from deb powerman
  command 'peg' from deb peg

编辑：我找到了文件 "pmg"，它看起来如下：

#!/home/ramfrey/anaconda3/bin/python

# -*- coding: utf-8 -*-
import re
import sys

from pymatgen.cli.pmg import main

if __name__ == '__main__':
    sys.argv[0] = re.sub(r'(-script\.pyw?|\.exe)?$', '', sys.argv[0])
    sys.exit(main())

如果我运行 python pmg 我得到错误：

Traceback (most recent call last):
  File "pmg", line 7, in <module>
    from pymatgen.cli.pmg import main
ImportError: No module named pymatgen.cli.pmg

但是这个确切的模块 "pymatgen.cli.pmg" 我可以毫无问题地导入我的 jupyter notebook。而且我还是不太明白，因为在安装指南中，它说应该直接运行 "pmg config…"

Answer 1

问题确实是我对运行 pmg 脚本使用了错误的 python 版本（这是一台工作计算机，有许多不同的 python 版本，我正在使用python 3.7.6 但有一个旧的 python 2.7 设置为默认值，在运行 "python pmg" 时使用。我运行 conda activate base 在我的 /home/username/anaconda3 然后 python pmg etc. 并且成功了。

pymatgen 的命令行工具

command line utility of pymatgen

python

linux

command-line-tool

pymatgen