将 excel (csv) 数据导入 R 进行生物信息学任务
Import excel (csv) data into R conducting bioinformatics task
我是一个正在通过 R 探索生物信息学的新手。现在我遇到了一个麻烦,我通过将 excel 中的数据更改为 csv 格式并使用 [=24] 将其导入 R =] 命令,正如您在图片中看到的那样,有 37 个变量(列),其中第一列应该被视为固定因子。而我想将它与下游处理中只有36个变量的另一个matirx匹配,我应该如何通过固定第一列来减少变量数?
非常感谢。
当然,我在此处添加了数据的 str() 属性。
如果我没记错的话,你正在寻找的是将 "Gene" 列设置为元数据,指示每一行中的这些值对应的基因。您可以尝试删除 Excel 文件中的单词 "Gene" 因为当您使用 read.csv()
函数导入它时,参数 row.names = TRUE
被设置为默认值 "there is a header and the first row contains one fewer field than the number of columns".
您可以使用 ?read.csv
找到有关此功能的更多信息
我是一个正在通过 R 探索生物信息学的新手。现在我遇到了一个麻烦,我通过将 excel 中的数据更改为 csv 格式并使用 [=24] 将其导入 R =] 命令,正如您在图片中看到的那样,有 37 个变量(列),其中第一列应该被视为固定因子。而我想将它与下游处理中只有36个变量的另一个matirx匹配,我应该如何通过固定第一列来减少变量数?
非常感谢。
当然,我在此处添加了数据的 str() 属性。
如果我没记错的话,你正在寻找的是将 "Gene" 列设置为元数据,指示每一行中的这些值对应的基因。您可以尝试删除 Excel 文件中的单词 "Gene" 因为当您使用 read.csv()
函数导入它时,参数 row.names = TRUE
被设置为默认值 "there is a header and the first row contains one fewer field than the number of columns".
您可以使用 ?read.csv