R:实现我自己的梯度提升算法
R: implementing my own gradient boosting algorithm
我正在尝试编写自己的梯度提升算法。我知道有 gbm
和 xgboost,
等现有包,但我想通过编写自己的包来了解算法的工作原理。
我正在使用iris
数据集,我的结果是Sepal.Length
(连续)。我的损失函数是mean(1/2*(y-yhat)^2)
(基本上就是前面有1/2的均方误差),所以我对应的梯度就是残差y - yhat
。我将预测初始化为 0。
library(rpart)
data(iris)
#Define gradient
grad.fun <- function(y, yhat) {return(y - yhat)}
mod <- list()
grad_boost <- function(data, learning.rate, M, grad.fun) {
# Initialize fit to be 0
fit <- rep(0, nrow(data))
grad <- grad.fun(y = data$Sepal.Length, yhat = fit)
# Initialize model
mod[[1]] <- fit
# Loop over a total of M iterations
for(i in 1:M){
# Fit base learner (tree) to the gradient
tmp <- data$Sepal.Length
data$Sepal.Length <- grad
base_learner <- rpart(Sepal.Length ~ ., data = data, control = ("maxdepth = 2"))
data$Sepal.Length <- tmp
# Fitted values by fitting current model
fit <- fit + learning.rate * as.vector(predict(base_learner, newdata = data))
# Update gradient
grad <- grad.fun(y = data$Sepal.Length, yhat = fit)
# Store current model (index is i + 1 because i = 1 contain the initialized estiamtes)
mod[[i + 1]] <- base_learner
}
return(mod)
}
据此,我将 iris
数据集拆分为训练和测试数据集,并使其适合我的模型。
train.dat <- iris[1:100, ]
test.dat <- iris[101:150, ]
learning.rate <- 0.001
M = 1000
my.model <- grad_boost(data = train.dat, learning.rate = learning.rate, M = M, grad.fun = grad.fun)
现在我从 my.model
计算预测值。对于 my.model
,拟合值为 0 (vector of initial estimates) + learning.rate * predictions from tree 1 + learning rate * predictions from tree 2 + ... + learning.rate * predictions from tree M
.
yhats.mymod <- apply(sapply(2:length(my.model), function(x) learning.rate * predict(my.model[[x]], newdata = test.dat)), 1, sum)
# Calculate RMSE
> sqrt(mean((test.dat$Sepal.Length - yhats.mymod)^2))
[1] 2.612972
我有几个问题
- 我的梯度提升算法看起来正确吗?
- 我是否正确计算了预测值
yhats.mymod
?
- 是的,这看起来是正确的。在每个步骤中,您都在拟合伪残差,这些伪残差被计算为损失相对于拟合的导数。您在问题开始时已经正确推导了这个梯度,甚至费心把 2 的因数弄对了。
- 这看起来也是正确的。您正在对模型进行汇总,按学习率加权,就像您在训练期间所做的那样。
但为了解决未被问到的问题,我注意到您的训练设置有一些怪癖。
iris
数据集在 3 个物种(setosa、versicolor、virginica)之间平分,这些在数据中是相邻的。您的训练数据包含所有 setosa 和 versicolor,而测试集包含所有 virginica 示例。没有重叠,会导致样本外问题。最好平衡你的训练和测试集以避免这种情况。
- 在我看来,学习率和模型数量的组合太低了。拟合收敛为
(1-lr)^n
。使用 lr = 1e-3
和 n = 1000
,您只能对 63.2% 的数据量级建模。也就是说,即使每个模型都正确预测每个样本,您也会估计正确值的 63.2%。用平均值而不是 0 初始化拟合会有所帮助,因为从那时起,效果是回归到均值,而不仅仅是拖累。
我正在尝试编写自己的梯度提升算法。我知道有 gbm
和 xgboost,
等现有包,但我想通过编写自己的包来了解算法的工作原理。
我正在使用iris
数据集,我的结果是Sepal.Length
(连续)。我的损失函数是mean(1/2*(y-yhat)^2)
(基本上就是前面有1/2的均方误差),所以我对应的梯度就是残差y - yhat
。我将预测初始化为 0。
library(rpart)
data(iris)
#Define gradient
grad.fun <- function(y, yhat) {return(y - yhat)}
mod <- list()
grad_boost <- function(data, learning.rate, M, grad.fun) {
# Initialize fit to be 0
fit <- rep(0, nrow(data))
grad <- grad.fun(y = data$Sepal.Length, yhat = fit)
# Initialize model
mod[[1]] <- fit
# Loop over a total of M iterations
for(i in 1:M){
# Fit base learner (tree) to the gradient
tmp <- data$Sepal.Length
data$Sepal.Length <- grad
base_learner <- rpart(Sepal.Length ~ ., data = data, control = ("maxdepth = 2"))
data$Sepal.Length <- tmp
# Fitted values by fitting current model
fit <- fit + learning.rate * as.vector(predict(base_learner, newdata = data))
# Update gradient
grad <- grad.fun(y = data$Sepal.Length, yhat = fit)
# Store current model (index is i + 1 because i = 1 contain the initialized estiamtes)
mod[[i + 1]] <- base_learner
}
return(mod)
}
据此,我将 iris
数据集拆分为训练和测试数据集,并使其适合我的模型。
train.dat <- iris[1:100, ]
test.dat <- iris[101:150, ]
learning.rate <- 0.001
M = 1000
my.model <- grad_boost(data = train.dat, learning.rate = learning.rate, M = M, grad.fun = grad.fun)
现在我从 my.model
计算预测值。对于 my.model
,拟合值为 0 (vector of initial estimates) + learning.rate * predictions from tree 1 + learning rate * predictions from tree 2 + ... + learning.rate * predictions from tree M
.
yhats.mymod <- apply(sapply(2:length(my.model), function(x) learning.rate * predict(my.model[[x]], newdata = test.dat)), 1, sum)
# Calculate RMSE
> sqrt(mean((test.dat$Sepal.Length - yhats.mymod)^2))
[1] 2.612972
我有几个问题
- 我的梯度提升算法看起来正确吗?
- 我是否正确计算了预测值
yhats.mymod
?
- 是的,这看起来是正确的。在每个步骤中,您都在拟合伪残差,这些伪残差被计算为损失相对于拟合的导数。您在问题开始时已经正确推导了这个梯度,甚至费心把 2 的因数弄对了。
- 这看起来也是正确的。您正在对模型进行汇总,按学习率加权,就像您在训练期间所做的那样。
但为了解决未被问到的问题,我注意到您的训练设置有一些怪癖。
iris
数据集在 3 个物种(setosa、versicolor、virginica)之间平分,这些在数据中是相邻的。您的训练数据包含所有 setosa 和 versicolor,而测试集包含所有 virginica 示例。没有重叠,会导致样本外问题。最好平衡你的训练和测试集以避免这种情况。- 在我看来,学习率和模型数量的组合太低了。拟合收敛为
(1-lr)^n
。使用lr = 1e-3
和n = 1000
,您只能对 63.2% 的数据量级建模。也就是说,即使每个模型都正确预测每个样本,您也会估计正确值的 63.2%。用平均值而不是 0 初始化拟合会有所帮助,因为从那时起,效果是回归到均值,而不仅仅是拖累。