线性回归并将结果存储在数据框中

Question

我正在运行对数据框中的某些变量进行线性回归。我希望能够通过分类变量对线性回归进行子集化，运行每个分类变量的线性回归，然后将 t-stats 存储在数据框中。如果可能的话，我想在没有循环的情况下执行此操作。

这是我正在尝试做的示例：

  a<-  c("a","a","a","a","a",
         "b","b","b","b","b",
         "c","c","c","c","c")     
  b<-  c(0.1,0.2,0.3,0.2,0.3,
         0.1,0.2,0.3,0.2,0.3,
         0.1,0.2,0.3,0.2,0.3)
  c<-  c(0.2,0.1,0.3,0.2,0.4,
         0.2,0.5,0.2,0.1,0.2,
         0.4,0.2,0.4,0.6,0.8)
      cbind(a,b,c)

我可以从运行进行以下线性回归并非常轻松地提取 t 统计量开始：

  summary(lm(b~c))$coefficients[2,3]

但是，我希望能够运行当 a 列为 a、b 或 c 时进行回归。然后我想将 t-stats 存储在 table 中，如下所示：

variable t-stat
a        0.9
b        2.4
c        1.1

希望这是有道理的。如果您有任何建议，请告诉我！

Answer 1

你可以这样做：

a<-  c("a","a","a","a","a",
       "b","b","b","b","b",
       "c","c","c","c","c")     
b<-  c(0.1,0.2,0.3,0.2,0.3,
       0.1,0.2,0.3,0.2,0.3,
       0.1,0.2,0.3,0.2,0.3)
c<-  c(0.2,0.1,0.3,0.2,0.4,
       0.2,0.5,0.2,0.1,0.2,
       0.4,0.2,0.4,0.6,0.8)
df <- data.frame(a,b,c)


t.stats <- t(data.frame(lapply(c('a','b','c'), 
             function(x) summary(lm(b~c,data=df[df$a==x,]))$coefficients[2,3])))
colnames(t.stats) <- 't-stat'
rownames(t.stats) <- c('a','b','c')

输出：

> t.stats
      t-stat
a  1.6124515
b -0.1369306
c  0.8000000

除非我弄错了，否则你在输出中给出的值是不正确的。

或者：

t.stats <- data.frame(t.stats)
t.stats$variable <- rownames(t.stats)

> t.stats[,c(2,1)]
  variable     t.stat
a        a  1.6124515
b        b -0.1369306
c        c  0.8000000

如果您想要 data.frame 和一个单独的列。

Answer 2

使用 split 对数据进行子集化并按 lapply

进行循环

dat <- data.frame(b,c)
dat_split <- split(x = dat, f = a)
res <- sapply(dat_split, function(x){
  summary(lm(b~c, data = x))$coefficients[2,3]
})

根据您的需要重塑结果：

data.frame(variable = names(res), "t-stat" = res) 

  variable     t.stat
a        a  1.6124515
b        b -0.1369306
c        c  0.8000000

Answer 3

您可以使用 nlme 包中的 lmList 函数将 lm 应用于数据子集：

# the data
df <- data.frame(a, b, c)

library(nlme)
res <- lmList(b ~ c | a, df, pool = FALSE)
coef(summary(res))

输出：

, , (Intercept)

   Estimate Std. Error  t value   Pr(>|t|)
a 0.1000000 0.08086075 1.236694 0.30418942
b 0.2304348 0.08753431 2.632508 0.07815663
c 0.1461538 0.10029542 1.457233 0.24110393

, , c

     Estimate Std. Error    t value  Pr(>|t|)
a  0.50000000  0.3100868  1.6124515 0.2052590
b -0.04347826  0.3175203 -0.1369306 0.8997586
c  0.15384615  0.1923077  0.8000000 0.4821990

如果只需要 t 值，可以使用此命令：

coef(summary(res))[, "t value", -1]
#          a          b          c 
#  1.6124515 -0.1369306  0.8000000

Answer 4

这是对 plyr 软件包和 ddply() 的投票。

plyrFunc <- function(x){
  mod <- lm(b~c, data = x)
  return(summary(mod)$coefficients[2,3])
  }

tStats <- ddply(dF, .(a), plyrFunc)
tStats
  a         V1
1 a  1.6124515
2 b -0.1369306
3 c  0.6852483

Answer 5

这是一个使用 broom 包中的 dplyr 和 tidy() 的解决方案。 tidy() 将各种统计模型输出（例如 lm、glm、anova 等）转换为整洁的数据框。

library(broom)
library(dplyr)

data <- data_frame(a, b, c)

data %>% 
  group_by(a) %>% 
  do(tidy(lm(b ~ c, data = .))) %>% 
  select(variable = a, t_stat = statistic) %>% 
  slice(2)

#   variable     t_stat
# 1        a  1.6124515
# 2        b -0.1369306
# 3        c  0.8000000

或同时提取截距和斜率项的 t 统计量：

data %>% 
  group_by(a) %>% 
  do(tidy(lm(b ~ c, data = .))) %>% 
  select(variable = a, term, t_stat = statistic)

#   variable        term     t_stat
# 1        a (Intercept)  1.2366939
# 2        a           c  1.6124515
# 3        b (Intercept)  2.6325081
# 4        b           c -0.1369306
# 5        c (Intercept)  1.4572335
# 6        c           c  0.8000000

线性回归并将结果存储在数据框中

Linear Regression and storing results in data frame

r

linear-regression

lm