samtools

Question

我在其他地方看到过其他一些类似的问题，但我似乎找不到适合我的解决方案。我正在尝试在 anaconda 上使用 python 运行 samtools。我是运行ning macosx catalina。这是错误代码

dyld: Library not loaded: @rpath/libcrypto.1.0.0.dylib
  Referenced from: /Users/me/anaconda3/bin/samtools
  Reason: image not found
zsh: abort      samtools

我已经尝试了各种努力通过 anaconda 安装早期版本的 openssl，但它仍然显示我安装了 openssl 版本 1.1.1。

感谢您提供有关如何 (a) 通过 anaconda 安装早期版本的 openssl 或 (b) 直接 samtools 评估早期版本的不同路径或 (c) 任何其他解决方案的任何指导。

Answer 1

好的，所以我对其他解决方案持开放态度，但如果其他人遇到此问题，这对我有用。

我从 sourceforge (https://sourceforge.net/projects/samtools/) 下载了这个包，并按照自述文件的说明编译了它。我没有使用路径中 anaconda 包中的运行 samtools，而是将这个新编译的文件移到了感兴趣的文件夹中。我从那里调用它如下：

cd users/me/desktop/example  (where samtools executable lives in this folder)

./samtools etc etc

我知道这对很多人来说是基本的，但对我来说不是，我希望这对以后遇到这个问题的其他人有所帮助

samtools - dyld：未加载库：@rpath/libcrypto.1.0.0.dylib

samtools - dyld: Library not loaded: @rpath/libcrypto.1.0.0.dylib

python

openssl

anaconda