使用 renv 时 Rscript 无法识别库

Question

我正在研究 Mac OSX，使用 R 的 v3.6.3 和 renv。在 Rstudio 和 R 中，我可以加载我安装的包的库，例如 library(ggplot2) 作品。但是，当我运行使用 Rscript 的脚本时，我收到消息

Error in library(ggplot2) : there is no package called ‘ggplot2’

根据这个 SO answer，我需要确保

的值

Sys.getenv('R_LIBS_USER') in R.exe

与

的值相同

Rscript.exe -e ".libPaths()"

但是值是一样的，都是指向我项目文件夹中的renv-system-library

那么我该如何解决这个问题？

Answer 1

最好在 library 调用

中指定 lib.loc

library(ggplot2, lib.loc = '/path/where/library/is/located')

Answer 2

我设法解决了这个问题。 ak运行的回答很有用，但没有用，但指出了错误的方向。答案无效，因为使用它时，我收到以下错误：

    Error: package or namespace load failed for ‘ggplot2’:
 .onLoad failed in loadNamespace() for 'pillar', details:
  call: utils::packageVersion("vctrs")
  error: there is no package called ‘vctrs’

现在 vctrs 在 '/path/where/library/is/located' 中，所以我认为依赖包不是从该路径加载的，而是 Rscript 的默认路径。在脚本中放入 print(.libPaths() 得到

"/usr/local/Cellar/r/3.6.3_1/lib/R/library"

而不是

[1] "/Users/Chris/Sites/app_name/renv/library/R-3.6/x86_64-apple-darwin18.7.0"
[2] "/private/var/folders/5_/p_yl0439059b7_jdqzrm0hr40000gr/T/RtmptdHcWN/renv-system-library"

对于 Rstudio 中的 .libPaths()。查看实际上运行ning Rscript 程序的 ruby 程序，我发现它运行带有 --vanilla 选项，即

Rscript --vanilla script_name

删除 --vanilla 选项解决了这个问题。我认为带有 --vanilla 选项的脚本停止工作是因为我使用 brew 重新安装了 R 来修复我遇到的另一个问题，并且作为这个问题的一部分发出了这个命令：

brew link --overwrite r

使用 renv 时 Rscript 无法识别库

Rscript is not recognising libraries when using renv

r

renv