为什么 Python 的 shutil.which() 不起作用？
Why is Python's shutil.which() not working?
我正在尝试查看 shutil.which() 是否可以从 NCBI 的 BLAST 中找到 blastn 命令。 运行 which blastn 在我的终端上的结果是 /usr/local/bin/blastn。但是，如果我做 shutil.which("blastn")，它只是 returns None。搜索 Python 效果很好，因为 shutil.which("python") returns /usr/bin/python。为什么会这样？
这意味着您的 shell 中的环境与 Python 运行时中的环境具有不同的 PATH。可能的原因有很多，但通常会发生，因为 .bashrc 中的某些内容附加到 PATH，这将在 shell 中看到，但不会被 Python.
看到
检查shell中的环境：
$ echo $PATH
检查Python中的环境：
import os
print(os.environ["PATH"])
您可能会发现 shell 的环境在 PATH 中有 blastn 的位置，而 Python 的没有。
我正在尝试查看 shutil.which() 是否可以从 NCBI 的 BLAST 中找到 blastn 命令。 运行 which blastn 在我的终端上的结果是 /usr/local/bin/blastn。但是，如果我做 shutil.which("blastn")，它只是 returns None。搜索 Python 效果很好，因为 shutil.which("python") returns /usr/bin/python。为什么会这样？
这意味着您的 shell 中的环境与 Python 运行时中的环境具有不同的 PATH。可能的原因有很多，但通常会发生，因为 .bashrc 中的某些内容附加到 PATH，这将在 shell 中看到，但不会被 Python.
检查shell中的环境：
$ echo $PATH
检查Python中的环境：
import os
print(os.environ["PATH"])
您可能会发现 shell 的环境在 PATH 中有 blastn 的位置，而 Python 的没有。