gnuplot 内部列参数与容器 bash 脚本参数冲突

Question

我在 bash 脚本中有以下代码，用于准备要绘图的输入数据。

当在 gnuplot 解释器中运行时，代码执行正常，但在 bash 脚本中，它替换了 $2，后者表示 ${outdir}/counts.txt 的第 2 列第二个 bash 参数的数据文件（输入文件与情节无关）

我如何编辑它以使 $1 和 $2 对 gnuplot 块保持私有？

  #!/bin/bash

  .. bash code

  gnuplot <<-EOFMarker
    set datafile separator ","
    set key autotitle columnhead
    set style line 1 \
        linecolor rgb '#0060ad' \
        linetype 1 linewidth 2 \
        pointtype 7 pointsize 1.5
    set yrange [*:100]
    set xlabel "mappability %"
    set ylabel "% above threshold"
    max(a,b)=a>b?a:b
    a=-99999999.
    set terminal pngcairo
    set output 'mappability_plot.png'
    plot '${outdir}/counts.txt' using 1:(a=max(a,),0/0) notitle, \
        '' using 1:(100*/a) notitle with linespoints linestyle 1
    EOFMarker

Answer 1

而不是 </code> 和 <code>，尝试 column(1) 和 column(2)...

Answer 2

您可以通过使用反斜杠转义 $ 字符来防止 shell 在此处文档中展开 $something：

gnuplot <<-EOFMarker
    [...]
    plot '${outdir}/counts.txt' using 1:(a=max(a,$2),0/0) notitle, \
        '' using 1:(100*$2/a) notitle with linespoints linestyle 1
    EOFMarker

注意 ${outdir} 没有转义，所以 shell 会继续并正常替换它。顺便说一句，您还需要转义您想要传递给程序而不被解释的任何反引号或反斜杠（转义）字符。

顺便说一句，它不适用于此处，但您可以通过引用分隔符来关闭此处文档中的所有替换：

gnuplot <<-'EOFMarker'
    $things `that` $won't \be $expanded
EOFMarker

在这里不起作用的原因是它也会阻止 shell 扩展 ${outdir}，我想这不是你想要的。

gnuplot 内部列参数与容器 bash 脚本参数冲突

gnuplot internal column argument clashes with container bash script arguments

bash

gnuplot

heredoc