将治疗随机分配给一组的一半

Question

我正在为实验随机分配处理方法。我有四个站点（Site1，... Site4），其中 12 个实验单元（例如，1 ... 12）被复制四次（例如，1 ... 4）。对于每个重复，我随机分配了三种处理方法之一（例如，trt1 ...trt3）。

我现在需要为我的每个站点的复制中的每个处理分配一个 SecondTreatment（是或否）。 trt2 应始终为 "y"，而我想将 "y" 随机分配给 trt1 的一半，将 "n" 分配给 trt1 的另一半，然后对 trt3 执行相同的操作。应该为每个复制给我：trt2 4 "y"、trt1 2 "n" 和 trt3 3 "n".

我的数据是这样的：

Site      Experimental unit     Replicate   Treatment        SecondTreatmentAssign (y/n)
Site1              1                1         trt1  
Site1              2                1         trt2  
Site1              3                1         trt3  
Site1              4                1         trt3  
Site1              5                1         trt1  
Site1              6                1         trt2  
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Site1              8                1         trt2  
Site1              9                1         trt1  
Site1              10               1         trt1  
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Site1              1                2         trt2  
Site1              2                2         trt3  
Site1              3                2         trt1  
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Site1              10               2         trt2  
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Site1              12               2         trt3      
Site1              1                3         trt2  
Site1              2                3         trt1  
Site1              3                3         trt3  
Site1              4                3         trt3  
Site1              5                3         trt2  
Site1              6                3         trt1  
Site1              7                3         trt3  
Site1              8                3         trt2  
Site1              9                3         trt1  
Site1              10               3         trt1  
Site1              11               3         trt3  
Site1              12               3         trt2  
Site1              1                4         trt3  
Site1              2                4         trt2  
Site1              3                4         trt1  
Site1              4                4         trt3  
Site1              5                4         trt2  
Site1              6                4         trt1  
Site1              7                4         trt3  
Site1              8                4         trt1  
Site1              9                4         trt2  
Site1              10               4         trt1  
Site1              11               4         trt2  
Site1              12               4         trt3
  .                .                .           .
  .                .                .           .
  .                .                .           .
Site4              12               4         trt1

我希望能够以一种无需手动移动任何东西的方式将这些分配返回到数据框中。我仍然是编程的新手，不确定如何实现这一点。

谢谢！

Answer 1

我会这样做：

library(dplyr) 
data %>% 
  arrange(runif(n())) %>% # randomize the order
  group_by(Site, Replicate, Treatment) %>% # group
  mutate(
    Treat_2 = case_when(
      Treatment == "trt2" ~ "y", # trt2 gets 'y'
      row_number() <= n() / 2 ~ "y", # others in the first half get "y"
      TRUE ~ "n" # others in the second half get "n"
  )) %>%
  arrange(Site, Replicate, `Experimental unit`) ## return to original order

将治疗随机分配给一组的一半

Random assignment of treatments to half of a group

random

r

experimental-design