有时升级到 R 4.0 和 Ubuntu 20.04 后命令不会终止
Sometimes commands do not terminate after upgrading to R 4.0 and Ubuntu 20.04
几天前我升级了 R（从 3.6 到 4.0）和 RStudio（从 1.1 到 1.2.5），Ubuntu 昨天从 18.04 升级到 20.04。
从那时起，R 有时 在执行某些命令时永远不会终止：ivreg（来自包 AER），summary（来自logit 回归）和 logitmfx（来自包 mfx）。有时这些命令 运行 很好，但大多数时候我必须终止进程 (killall rstudio) 因为 R 不会终止执行，即使按下 RStudio 中的红色停止按钮也是如此。
当我尝试 example('AER') 时，效果很好。然后我重新安装了软件包 AER。它抛出了 10 个 In readLines(file, skipNul = TRUE) : cannot open compressed file '/usr/lib/R/site-library/[package]/DESCRIPTION', probable reason 'No such file or directory' 类型的警告，其中 [package] 是 abind、colorspace、dichromat...（但不是 AER）。
此后 example('AER') 发出警告：no help found for ‘AER’。
我已经删除并重新安装了 R 4.0：它没有帮助。此外，apt purge r-base* r-recommended r-cran-* 发出警告：dpkg: warning: while removing r-base-core, directory '/usr/lib/R/site-library' not empty so not removed。此外，还有一堆 Package [package] is not installed, so not removed，包括 [package] 等于 r-cran-abind 和上面列出的其他（这个 purge 也返回了一堆 Note, selecting [package] for glob 'r-cran-*'） .
我还没有尝试过在没有 RStudio 的情况下使用 R。在升级到 Ubuntu 20.04 期间，我可能正在使用 RStudio。另外，我不记得这个问题是在我升级 R 和 RStudio 之后（这是我最好的猜测）还是在我升级 Ubuntu（一两天后）之后开始的。
希望有人能帮忙。
Dirk Eddelbuettel 和 Sébastien Villemot 通过 r-sig-debian mailing list 提供了解决方案。
我不知道这是否有必要，但我首先做了：
sudo update-alternatives --config libblas.so.3-x86_64-linux-gnu
和select /usr/lib/x86_64-linux-gnu/blas/libblas.so.3（而不是pthread）。
然后（成功了）：
sudo apt install libopenblas-openmp-dev
sudo apt remove libopenblas-pthread-dev libopenblas0-pthread
几天前我升级了 R（从 3.6 到 4.0）和 RStudio（从 1.1 到 1.2.5），Ubuntu 昨天从 18.04 升级到 20.04。
从那时起，R 有时 在执行某些命令时永远不会终止：ivreg（来自包 AER），summary（来自logit 回归）和 logitmfx（来自包 mfx）。有时这些命令 运行 很好，但大多数时候我必须终止进程 (killall rstudio) 因为 R 不会终止执行，即使按下 RStudio 中的红色停止按钮也是如此。
当我尝试 example('AER') 时，效果很好。然后我重新安装了软件包 AER。它抛出了 10 个 In readLines(file, skipNul = TRUE) : cannot open compressed file '/usr/lib/R/site-library/[package]/DESCRIPTION', probable reason 'No such file or directory' 类型的警告，其中 [package] 是 abind、colorspace、dichromat...（但不是 AER）。
此后 example('AER') 发出警告：no help found for ‘AER’。
我已经删除并重新安装了 R 4.0：它没有帮助。此外，apt purge r-base* r-recommended r-cran-* 发出警告：dpkg: warning: while removing r-base-core, directory '/usr/lib/R/site-library' not empty so not removed。此外，还有一堆 Package [package] is not installed, so not removed，包括 [package] 等于 r-cran-abind 和上面列出的其他（这个 purge 也返回了一堆 Note, selecting [package] for glob 'r-cran-*'） .
我还没有尝试过在没有 RStudio 的情况下使用 R。在升级到 Ubuntu 20.04 期间，我可能正在使用 RStudio。另外，我不记得这个问题是在我升级 R 和 RStudio 之后（这是我最好的猜测）还是在我升级 Ubuntu（一两天后）之后开始的。
希望有人能帮忙。
Dirk Eddelbuettel 和 Sébastien Villemot 通过 r-sig-debian mailing list 提供了解决方案。
我不知道这是否有必要，但我首先做了：
sudo update-alternatives --config libblas.so.3-x86_64-linux-gnu
和select /usr/lib/x86_64-linux-gnu/blas/libblas.so.3（而不是pthread）。
然后（成功了）：
sudo apt install libopenblas-openmp-dev
sudo apt remove libopenblas-pthread-dev libopenblas0-pthread