rpy2: json.dumps() 的输出确实不是正确的 json 对象

Question

在我的后端代码中，我使用 rpy2 从 python 调用了 R 函数，并且我的 R 函数有字典输出，我需要将其呈现为 JSON 在我的服务器端点。但是我的字典 json.dumps() 的输出实际上不是 JSON 对象。我想通了，因为 R 函数的输出为 StrVector，我必须在字典中对输出数据进行字符串化，然后使用 json.dumps，但仍然无法获得正确格式的 JSON。

为什么 json.dumps 对字典中的数据表现得很奇怪？在端点获取正确 JSON 结构化数据的正确方法是什么？有什么想法吗？

在字典中输入数据:

这里是R函数返回的字典中的数据。这本词典的类型是 <class 'rpy2.robjects.vectors.StrVector'>

mydict = {"score":[72.188,62.0955,19.3374],"category":"medium",
"guidance":"text description","readiness":true,
"features_used":{"name":"gcstotal","value":null,
"range_value":[3.6667,5,6.3333,7.6667,9,10.3333,11.6667,13,14.3333],
"range_frequency":[0.0024,0,0.0049,0.0016,0.0073,0.0195,0.0098,0.0138,0.9406],"importance":0}}

更新:

我刚刚对 mydict 进行了质量检查，它是 <class 'rpy2.robjects.vectors.StrVector'>，所以我在我的代码中尝试了以下：

json.dumps(str(mydict))

然后我最终低于输出。我从 python 调用了 R 函数，并且我使用 rpy2 这样做，但是 StrVector 的 json.dumps() 的输出并不是真正的 json。为什么？有什么想法吗？

当我将这本词典提供给 json.dumps(mydict ) 时，我得到了这个输出：

"{\"score\":[72.188,62.0955,19.3374],\"category\":\"medium\",
\"guidance\":\"text description\",\"readiness_flag\":true,
\"features_used\":{\"name\":\"gcstotal\",\"value\":null,
\"range_value\":[3.6667,5,6.3333,7.6667,9,10.3333,11.6667,13,14.3333],
\"range_frequency\":[0.0024,0,0.0049,0.0016,0.0073,0.0195,0.0098,0.0138,0.9406],\"importance\":0}} \n"

我只是不明白为什么最终得到来自 json.dumps 的非 JSON 对象。是 json.dumps 的问题还是我在服务器端点对 jsonify 字典使用了错误的方式？为什么我有以上输出？任何的想法？谢谢

更新 2：：

在我尝试@Victor S 解决方案后，它适用于粘贴的字典，但我不确定我是否可以按如下方式装饰 mydict 对象：

def post(self):
        if not request.get_json():
            return bad_request('No input data provided')
        raw_dict = request.json
        input_json = json.dumps(raw_dict)
        mydict = my_R_func(input_json)
        mydict = """mydict"""  ## inspired from @Victor S
        res = json.loads(str(mydict))
        res = json.dumps(res)
        return jsonify(res)

我可以装饰mydict = my_R_func(input_json); mydict = """ mydict """ ?有什么办法吗？

Answer 1

尝试

dict(zip(mydict.names, map(list, list(mydict))))

感谢@CT Zhu this answer

显然这不会处理嵌套列表，因此您也可以使用 rpy2（pip install rpy2）：

from rpy2.robjects import pandas2ri
pandas2ri.activate()

pandas2ri.ri2py(mydict)
Out[294]:
{"score":[72.188,62.0955,19.3374],"category":"medium",
"guidance":"text description","readiness":true,
"features_used":{"name":"gcstotal","value":null,
"range_value":[3.6667,5,6.3333,7.6667,9,10.3333,11.6667,13,14.3333],
"range_frequency":[0.0024,0,0.0049,0.0016,0.0073,0.0195,0.0098,0.0138,0.9406],"importance":0}}

rpy2 documentation

Answer 2

当您调用 json.dumps() 时，您需要向其传递一个有效的 Python 字典。例如，您的 "readiness":true true 会抛出错误，因为它不是有效的 Python 布尔变量，而是 JSON 语法。

尝试以下方法解决此问题。

import json

mydict = """{"score":[72.188,62.0955,19.3374],"category":"medium",
"guidance":"text description","readiness":true,
"features_used":{"name":"gcstotal","value":null,
"range_value":[3.6667,5,6.3333,7.6667,9,10.3333,11.6667,13,14.3333],
"range_frequency":[0.0024,0,0.0049,0.0016,0.0073,0.0195,0.0098,0.0138,0.9406],"importance":0}}"""

# convert to string
mydict_str = json.loads(mydict)

# to json obj.
tojson = json.dumps(mydict_str , indent=4)
print(tojson)

rpy2: json.dumps() 的输出确实不是正确的 json 对象

rpy2: output of json.dumps() is really not proper json object

python

r

json

rpy2