PlotnineAnimation with changing scales throws error: 'The fill scale of plot for frame 1 has different limits from those of the first frame.'
PlotnineAnimation with changing scales throws error: 'The fill scale of plot for frame 1 has different limits from those of the first frame.'
我正在尝试使用 gganimate (R) 等价物 plotnine (python)。我 运行 在其中一个情节引入新的美学尺度类别时遇到问题，导致控制台抛出错误：The fill scale of plot for frame 1 has different limits from those of the first frame.
这似乎是必须生成所有图的生成器，然后将它们粘在一起的结果 - 根据 plotnine 文档 (https://plotnine.readthedocs.io/en/stable/generated/plotnine.animation.PlotnineAnimation.html)。当我使用 gganimate() 时，图书馆足够聪明，知道检查所有将被调用的比例并相应地打印完整的比例。
我尝试使用 scale_fill_manual() 将比例强制添加到第一个图上作为处理此问题的方法，但它不起作用（在 R 或 python 中）。
我正在 plotnine 中寻找解决此问题的方法（如果 python 中有更好的动画模块，如果有建议我可以学习）。
这是一个有效的例子：
第一次尝试 plotnine:
#import modules
import pandas as pd
from plotnine import *
from plotnine.animation import PlotnineAnimation
#create the dataframe
df = pd.DataFrame({'run': [1, 1, 1, 2, 2, 2],
'x_pos': [1, 2, 3, 2, 3, 4],
'y_pos': [4, 5, 6, 5, 6, 7],
'status': ['A', 'B', 'A', 'A', 'B', 'C'] })
#write a function that creates all the plots
def plot(x):
df2 = df[df['run'] == x]
p = (ggplot(df2,
aes(x = 'x_pos', y = 'y_pos', fill = 'status'))
+ geom_point()
)
return(p)
#save the plots as a generator as per the plotnine docs (https://plotnine.readthedocs.io/en/stable/generated/plotnine.animation.PlotnineAnimation.html)
plots = (plot(i) for i in range(1, 3))
#create the animation
animation = PlotnineAnimation(plots, interval=100, repeat_delay=500)
抛出错误：PlotnineError: 'The fill scale of plot for frame 1 has different limits from those of the first frame.'
如果我在 R 中使用 gganimate() 执行此操作，一切正常 - 我从一开始就获得了所有三种色标：
library('ggplot2')
library('gganimate')
df <- data.frame(run = c(1, 1, 1, 2, 2, 2),
x_pos = c(1, 2, 3, 2, 3, 4),
y_pos = c(4, 5, 6, 5, 6, 7),
status = c('A', 'B', 'A', 'A', 'B', 'C'))
ggplot(df, aes(x = x_pos, y = y_pos, col = status)) +
geom_point() +
transition_states(run)
当我尝试在第一个图上强制缩放时，它不起作用。 R 中的第一个：
library(dplyr)
df %>%
filter(run == 1) %>%
ggplot(aes(x = x_pos, y = y_pos, col = status)) +
geom_point() +
scale_color_manual(labels = c('A', 'B', 'C'),
values = c('red', 'green', 'blue'))
该图仅显示了两个色标 - 尽管在 scale_color_manual():
中明确说明了 3
然后在Python:
#Filter the data frame created above
df2 = df[df['run'] == 1]
#Create the plot - stating scale_fill_manual()
p = (ggplot(df2,
aes(x = 'x_pos', y = 'y_pos', fill = 'status'))
+ geom_point()
+ scale_fill_manual(labels = ['A', 'B', 'C'],
values = ['red', 'blue', 'green'])
)
#Print the plot
print(p)
抛出有关数组长度错误 (ValueError: arrays must all be same length) 的错误，这是有道理的：我要求的值和颜色比过滤数据集中的更多。这意味着我不能让第一帧匹配第二帧，这是我试图解决的错误。
任何人都知道如何使用 plotnine 使其工作，就像在 gganimate() 中一样？此外（虽然不那么重要），关于为什么 plotnine 需要 fill 代替 geom_point()，而 ggplot2 需要 col 代替 geom_point()?
的任何想法
在python中，你应该使status成为一个绝对的，如果你把它留给绘图系统，它可能会弄错。
在 Plotnine 中，geom_point 的所有关键绘图形状都有内部区域和周围的笔画，因此您可以使用 fill 和 color 来定位。但这是一个很可能会让用户感到沮丧的复杂细节，因此当您映射到 color 而不是 fill 时，它会为两者设置相同的颜色。在这两者之间，Plotnine 不识别缩写 col.
import pandas as pd
from plotnine import *
from plotnine.animation import PlotnineAnimation
#create the dataframe
df = pd.DataFrame({'run': [1, 1, 1, 2, 2, 2],
'x_pos': [1, 2, 3, 2, 3, 4],
'y_pos': [4, 5, 6, 5, 6, 7],
'status': ['A', 'B', 'A', 'A', 'B', 'C'] })
# A categorical ensures that each of the sub-dataframes
# can be used to create a scale with the correct limits
df['status'] = pd.Categorical(df['status'])
#write a function that creates all the plots
def plot(x):
df2 = df[df['run'] == x]
p = (ggplot(df2,
aes(x = 'x_pos', y = 'y_pos', color = 'status'))
+ geom_point()
# Specify the limits for the x and y aesthetics
+ scale_x_continuous(limits=(df.x_pos.min(), df.x_pos.max()))
+ scale_y_continuous(limits=(df.y_pos.min(), df.y_pos.max()))
+ theme(subplots_adjust={'right': 0.85}) # Make space for the legend
)
return(p)
plots = (plot(i) for i in range(1, 3))
#create the animation
animation = PlotnineAnimation(plots, interval=1000, repeat_delay=500)
animation
我正在尝试使用 gganimate (R) 等价物 plotnine (python)。我 运行 在其中一个情节引入新的美学尺度类别时遇到问题，导致控制台抛出错误：The fill scale of plot for frame 1 has different limits from those of the first frame.
这似乎是必须生成所有图的生成器，然后将它们粘在一起的结果 - 根据 plotnine 文档 (https://plotnine.readthedocs.io/en/stable/generated/plotnine.animation.PlotnineAnimation.html)。当我使用 gganimate() 时，图书馆足够聪明，知道检查所有将被调用的比例并相应地打印完整的比例。
我尝试使用 scale_fill_manual() 将比例强制添加到第一个图上作为处理此问题的方法，但它不起作用（在 R 或 python 中）。
我正在 plotnine 中寻找解决此问题的方法（如果 python 中有更好的动画模块，如果有建议我可以学习）。
这是一个有效的例子：
第一次尝试 plotnine:
#import modules
import pandas as pd
from plotnine import *
from plotnine.animation import PlotnineAnimation
#create the dataframe
df = pd.DataFrame({'run': [1, 1, 1, 2, 2, 2],
'x_pos': [1, 2, 3, 2, 3, 4],
'y_pos': [4, 5, 6, 5, 6, 7],
'status': ['A', 'B', 'A', 'A', 'B', 'C'] })
#write a function that creates all the plots
def plot(x):
df2 = df[df['run'] == x]
p = (ggplot(df2,
aes(x = 'x_pos', y = 'y_pos', fill = 'status'))
+ geom_point()
)
return(p)
#save the plots as a generator as per the plotnine docs (https://plotnine.readthedocs.io/en/stable/generated/plotnine.animation.PlotnineAnimation.html)
plots = (plot(i) for i in range(1, 3))
#create the animation
animation = PlotnineAnimation(plots, interval=100, repeat_delay=500)
抛出错误：PlotnineError: 'The fill scale of plot for frame 1 has different limits from those of the first frame.'
如果我在 R 中使用 gganimate() 执行此操作，一切正常 - 我从一开始就获得了所有三种色标：
library('ggplot2')
library('gganimate')
df <- data.frame(run = c(1, 1, 1, 2, 2, 2),
x_pos = c(1, 2, 3, 2, 3, 4),
y_pos = c(4, 5, 6, 5, 6, 7),
status = c('A', 'B', 'A', 'A', 'B', 'C'))
ggplot(df, aes(x = x_pos, y = y_pos, col = status)) +
geom_point() +
transition_states(run)
当我尝试在第一个图上强制缩放时，它不起作用。 R 中的第一个：
library(dplyr)
df %>%
filter(run == 1) %>%
ggplot(aes(x = x_pos, y = y_pos, col = status)) +
geom_point() +
scale_color_manual(labels = c('A', 'B', 'C'),
values = c('red', 'green', 'blue'))
该图仅显示了两个色标 - 尽管在 scale_color_manual():
然后在Python:
#Filter the data frame created above
df2 = df[df['run'] == 1]
#Create the plot - stating scale_fill_manual()
p = (ggplot(df2,
aes(x = 'x_pos', y = 'y_pos', fill = 'status'))
+ geom_point()
+ scale_fill_manual(labels = ['A', 'B', 'C'],
values = ['red', 'blue', 'green'])
)
#Print the plot
print(p)
抛出有关数组长度错误 (ValueError: arrays must all be same length) 的错误，这是有道理的：我要求的值和颜色比过滤数据集中的更多。这意味着我不能让第一帧匹配第二帧，这是我试图解决的错误。
任何人都知道如何使用 plotnine 使其工作，就像在 gganimate() 中一样？此外（虽然不那么重要），关于为什么 plotnine 需要 fill 代替 geom_point()，而 ggplot2 需要 col 代替 geom_point()?
在python中，你应该使status成为一个绝对的，如果你把它留给绘图系统，它可能会弄错。
在 Plotnine 中，geom_point 的所有关键绘图形状都有内部区域和周围的笔画，因此您可以使用 fill 和 color 来定位。但这是一个很可能会让用户感到沮丧的复杂细节，因此当您映射到 color 而不是 fill 时，它会为两者设置相同的颜色。在这两者之间，Plotnine 不识别缩写 col.
import pandas as pd
from plotnine import *
from plotnine.animation import PlotnineAnimation
#create the dataframe
df = pd.DataFrame({'run': [1, 1, 1, 2, 2, 2],
'x_pos': [1, 2, 3, 2, 3, 4],
'y_pos': [4, 5, 6, 5, 6, 7],
'status': ['A', 'B', 'A', 'A', 'B', 'C'] })
# A categorical ensures that each of the sub-dataframes
# can be used to create a scale with the correct limits
df['status'] = pd.Categorical(df['status'])
#write a function that creates all the plots
def plot(x):
df2 = df[df['run'] == x]
p = (ggplot(df2,
aes(x = 'x_pos', y = 'y_pos', color = 'status'))
+ geom_point()
# Specify the limits for the x and y aesthetics
+ scale_x_continuous(limits=(df.x_pos.min(), df.x_pos.max()))
+ scale_y_continuous(limits=(df.y_pos.min(), df.y_pos.max()))
+ theme(subplots_adjust={'right': 0.85}) # Make space for the legend
)
return(p)
plots = (plot(i) for i in range(1, 3))
#create the animation
animation = PlotnineAnimation(plots, interval=1000, repeat_delay=500)
animation