查询如何在 R 中使用 ggplot 制作世界热图？

Question

我想制作一张特定疾病的世界热图。该数据集包含国家列表、纬度、经度和每个国家的案例。数据可用 here。我想用世界热图来表示它，即案例较多的国家应该有较深的颜色，而案例较少的国家应该变亮。我已经使用 ggplot 和 geom_map 来创建相同的。代码如下：

library(maps)
library(plyr)
library(gridExtra)

h2 <- read_excel("mapdata1.xlsx")

world_map <- map_data("world")
world_map <- subset(world_map, region!="Antarctica")

gg <- ggplot(h2)
gg <- gg + geom_map(dat=world_map, map = world_map, aes(map_id=region), 
                    fill="white", color="#7f7f7f", size=0.25)
gg <- gg + geom_map(map = world_map, aes(map_id = Country, fill = Cases), size=0.25)
gg <- gg + scale_fill_gradient(low="#fff7bc", high="#cc4c02", name="Total Cases")
gg <- gg + expand_limits(x = world_map$long, y = world_map$lat)
gg <- gg + labs(x="", y="", title="World Hotspots")
gg <- gg + theme(panel.grid=element_blank(), panel.border=element_blank())
gg <- gg + theme(axis.ticks=element_blank(), axis.text=element_blank())
gg <- gg + theme(legend.position="top")
gg

当我运行代码时，它显示了热图，但某些国家/地区（例如美国）是白色的，尽管它的案例数量更多。我不明白为什么会这样？

Answer 1

原因很简单，美国在您的数据和世界地图中的名称不同。

library(maps)
library(ggplot2)

mydata <- readxl::read_excel("your_path")

mydata$Country[mydata$Country == "United States"] <- "USA"

world_map <- map_data("world")
world_map <- subset(world_map, region != "Antarctica")

ggplot(mydata) +
  geom_map(
    dat = world_map, map = world_map, aes(map_id = region),
    fill = "white", color = "#7f7f7f", size = 0.25
  ) +
  geom_map(map = world_map, aes(map_id = Country, fill = Cases), size = 0.25) +
  scale_fill_gradient(low = "#fff7bc", high = "#cc4c02", name = "Total Cases") +
  expand_limits(x = world_map$long, y = world_map$lat)

^{由 reprex package (v0.3.0)}

于 2020-05-16 创建

查询如何在 R 中使用 ggplot 制作世界热图？

Query on how to make world heat map using ggplot in R?

r

data-visualization

ggplot2

ggplotly