如何通过fitdistrplus包select分布参数？

Question

library(fitdistrplus)
data(groundbeef)
serving <- groundbeef$serving
fitg <- fitdist(serving, "gamma")
res<-bootdist(fitg)#further accuracy estimate
#which parameter should be selected?
> summary(res)
Parametric bootstrap medians and 95% percentile CI 
Median       2.5%      97.5%
shape 4.04523398 3.41773958 4.80480936
rate  0.05495878 0.04632007 0.06587446
> res$fitpart$estimate
shape       rate 
4.00825257 0.05441911

bootdist() 总是用于在 fitdis() 之后获得更准确的参数。

如上例，summary(res)提供了几个参数，res$fitpart$estimate提供了一个参数，应该选择哪个？

Answer 1

来自help(bootdist)：

Uses parametric or nonparametric bootstrap resampling in order to simulate uncertainty in the parameters of the distribution fitted to non-censored data.

因此，bootdist的目的不是确定参数，而是估计参数拟合的不确定性。

因此，一般来说，您应该使用：

fitg$estimate
     shape       rate 
4.00825257 0.05441911

Answer 2

当您执行 bootstrap 时，您通过替换对数据进行采样，并重新估计参数。在这种情况下，您将分布拟合到从原始数据集中采样的数据集中。

通过这 N 个估计值，您可以得到中位数和置信区间。

如果您想要最适合您数据的参数，您需要从 fitdist(serving, "gamma")

中获取

如何通过fitdistrplus包select分布参数？

How to select the distribution parameter through fitdistrplus package?

statistics

r

fitdistrplus