关于R包发布和代码可见性的问题
Questions about R package publishing and code visibility
当我在 R 中使用包时，我会安装它并在加载时使用它。现在如果我添加一个使用另一个包的包怎么办？这个包是否也自动下载和加载？还是一般禁止 R 包使用另一个包？我不这么认为。
假设我想发布一个 R 包。在我的代码中，我可以使用其他包中的函数并安装和加载这些包吗？或者当我需要其他包的功能时，它是如何工作的？我是否必须实现一条消息，说明需要这个和那个包，用户必须先安装和加载它，我需要实现错误捕获功能，以防在 pc 系统上找不到该包？
当我想发布 R 包时，我可以 use/call Java 我的 package/code 中的代码吗？
对于已经发布的包 - 让我们以 fGarch 包为例 - 我希望看到完整的代码。我怎么能看到这个？我知道 R 是开源的，我认为只输入一个空函数并显示代码或多或少是可能的，但有时这是行不通的，尤其是我的问题是：有没有一种方法可以查看整个函数包裹代码？
对于已经发布的包，是否可以查看和查看所有提交的文件？所以像 git 这样的存储库，其中提交了所有文件 - 代码本身和其他需要的文件，如描述文件或其他 - 我可以看到这些文件并查看它们？
此外，关于 和隐藏函数：R 包中是否有我作为最终用户看不到的代码？这也涉及到我之前的问题，我如何或通过哪种方式可以看到 R 包中的整个代码？
我猜你有几个不同的问题。让我们按照您要求的顺序来接受他们：
What if I add a package which uses another package? Is this package automatically downloaded and loaded too? Or is it in general forbidden for a R package to use another package?
当然不禁止一个R包使用另一个R包。事实上，大多数 R 包 依赖 其他包。
每个 R 包的源代码必须在根目录中包含一个基于文本的 DESCRIPTION 文件。在此文件中，您会发现（除其他事项外）“依赖”字段和“导入”字段。这两个字段一起列出所有其他包 required 以使用 this 包。如果用户还没有在他们的本地库中安装这些其他包，R 将在安装请求的包时自动安装它们。
如果您的包在“Depends”中列出了依赖项，那么无论何时附加您的包，都会附加依赖项包。因此，如果您查看名为“foo”的包的源代码，您会看到它的 DESCRIPTION 文件包含行
Depends: bar,
您知道当您在 R 控制台中调用 library(foo) 时，您实际上已经完成了 library(bar); library(foo)
这并不总是理想的。包 foo 可能只需要包 bar 中的几个函数，而 bar 可能包含一些其他函数，这些函数的名称可能与其他常用函数冲突。因此，一般来说，如果您正在编写一个包并且您只想使用另一个包中的几个函数，最好使用“导入”而不是“依赖”来限制添加到用户的不必要符号的数量搜索路径。
Suppose I want to publish a R package. Within my code, can I use functions from other packages and install and load these packages
是的，您可以使用其他包中的函数。最简单的方法是在 DESCRIPTION 文件的 Depends 字段中包含包的名称。
但是，如果只在您自己的包中使用其他包中的几个函数，最佳做法是使用 DESCRIPTION 文件中的“Imports”字段，并为导入的函数使用名称空间限定符您实际的 R 代码。例如，如果您想使用 ggplot2 包中的 ggplot，那么在您的函数中您可以将其称为 ggplot2::ggplot 而不仅仅是 ggplot.
如果您发布包供其他人使用，如果用户使用默认设置调用 install.packages，依赖项将与您的包一起自动安装。例如，当我这样做时：
install.packages("fGarch")
我收到相关消息：
#> also installing the dependencies ‘timeSeries’, ‘fBasics’, ‘fastICA’
Do I have to implement a message that this and that package is needed and that the user has to install and load it prior to it and I need to implement error catching functions in case the package cannot be found on the pc system?
不，一般情况下不会。只要您在 DESCRIPTION 文件中列出了正确的包，R 就会处理这个问题。
When I want to publish a R package, can I use/call Java code within my package/code?
R 没有原生 Java API，但您可以通过 rJava package 使用您自己的 Java 代码，您可以将其列为对你的包裹。但是，有些用户很难从 Java 升级到 运行，例如可能使用 R 但未安装 Java 且没有安装管理员权限的商业和学术用户它，所以这是写包时要记住的事情。
For a package which was already published - so let's take just as an example the fGarch package - I would like to see the complete code. How can I see this?
每个可从 CRAN 下载的包都有其源代码。在 fGarch 的情况下，它是 CRAN page contains a link to the gzipped tarball of the source code. You can download this and use untar in R to review all the source code. Alternatively, many packages will have an easily-found repository on Github or other source-control sites where you can examine the source code via a browser. For example, you can browse the fGarch source on Github here.
For a package which was already published, is it possible to see and look into all files which were submitted? So like a repository as git where all files are submitted - the code itself and further files which are needed like description files or whatever - and I can see these files and look into them?
是的，您可以在非官方 Github CRAN 镜像 here
查看 Github 上上传到 CRAN 的所有包的所有源文件
Is there code in a R package which I cannot see as an end user? This refers also to my previous question, how can I or which way can I see the whole code in a R package?
如上所述，您可以通过 CRAN 或 Github 获取任何包的源代码。如您所说，您只需在 R 中键入该函数的名称即可查看 exported 函数的源代码。对于未导出的函数，您可以使用三个冒号执行相同的操作。例如，ggplot2:::adjust_breaks 允许您从 ggplot2 中查看未导出函数 adjust_breaks 的函数体。当使用像 S4、ggproto 或 R6 这样的面向对象系统时，或者当源代码包含编译的 C 或 C++ 代码时，会有一些复杂性，但我还没有遇到过无法找到的情况一两分钟后使用 R 控制台和良好的搜索引擎获得相关源代码。
当我在 R 中使用包时，我会安装它并在加载时使用它。现在如果我添加一个使用另一个包的包怎么办？这个包是否也自动下载和加载？还是一般禁止 R 包使用另一个包？我不这么认为。
假设我想发布一个 R 包。在我的代码中，我可以使用其他包中的函数并安装和加载这些包吗？或者当我需要其他包的功能时，它是如何工作的？我是否必须实现一条消息，说明需要这个和那个包，用户必须先安装和加载它，我需要实现错误捕获功能，以防在 pc 系统上找不到该包？
当我想发布 R 包时，我可以 use/call Java 我的 package/code 中的代码吗？
对于已经发布的包 - 让我们以 fGarch 包为例 - 我希望看到完整的代码。我怎么能看到这个？我知道 R 是开源的，我认为只输入一个空函数并显示代码或多或少是可能的，但有时这是行不通的，尤其是我的问题是：有没有一种方法可以查看整个函数包裹代码？
对于已经发布的包，是否可以查看和查看所有提交的文件？所以像 git 这样的存储库，其中提交了所有文件 - 代码本身和其他需要的文件，如描述文件或其他 - 我可以看到这些文件并查看它们？
此外，关于
我猜你有几个不同的问题。让我们按照您要求的顺序来接受他们：
What if I add a package which uses another package? Is this package automatically downloaded and loaded too? Or is it in general forbidden for a R package to use another package?
当然不禁止一个R包使用另一个R包。事实上，大多数 R 包 依赖 其他包。
每个 R 包的源代码必须在根目录中包含一个基于文本的 DESCRIPTION 文件。在此文件中，您会发现（除其他事项外）“依赖”字段和“导入”字段。这两个字段一起列出所有其他包 required 以使用 this 包。如果用户还没有在他们的本地库中安装这些其他包，R 将在安装请求的包时自动安装它们。
如果您的包在“Depends”中列出了依赖项，那么无论何时附加您的包，都会附加依赖项包。因此，如果您查看名为“foo”的包的源代码，您会看到它的 DESCRIPTION 文件包含行
Depends: bar,
您知道当您在 R 控制台中调用 library(foo) 时，您实际上已经完成了 library(bar); library(foo)
这并不总是理想的。包 foo 可能只需要包 bar 中的几个函数，而 bar 可能包含一些其他函数，这些函数的名称可能与其他常用函数冲突。因此，一般来说，如果您正在编写一个包并且您只想使用另一个包中的几个函数，最好使用“导入”而不是“依赖”来限制添加到用户的不必要符号的数量搜索路径。
Suppose I want to publish a R package. Within my code, can I use functions from other packages and install and load these packages
是的，您可以使用其他包中的函数。最简单的方法是在 DESCRIPTION 文件的 Depends 字段中包含包的名称。
但是，如果只在您自己的包中使用其他包中的几个函数，最佳做法是使用 DESCRIPTION 文件中的“Imports”字段，并为导入的函数使用名称空间限定符您实际的 R 代码。例如，如果您想使用 ggplot2 包中的 ggplot，那么在您的函数中您可以将其称为 ggplot2::ggplot 而不仅仅是 ggplot.
如果您发布包供其他人使用，如果用户使用默认设置调用 install.packages，依赖项将与您的包一起自动安装。例如，当我这样做时：
install.packages("fGarch")
我收到相关消息：
#> also installing the dependencies ‘timeSeries’, ‘fBasics’, ‘fastICA’
Do I have to implement a message that this and that package is needed and that the user has to install and load it prior to it and I need to implement error catching functions in case the package cannot be found on the pc system?
不，一般情况下不会。只要您在 DESCRIPTION 文件中列出了正确的包，R 就会处理这个问题。
When I want to publish a R package, can I use/call Java code within my package/code?
R 没有原生 Java API，但您可以通过 rJava package 使用您自己的 Java 代码，您可以将其列为对你的包裹。但是，有些用户很难从 Java 升级到 运行，例如可能使用 R 但未安装 Java 且没有安装管理员权限的商业和学术用户它，所以这是写包时要记住的事情。
For a package which was already published - so let's take just as an example the fGarch package - I would like to see the complete code. How can I see this?
每个可从 CRAN 下载的包都有其源代码。在 fGarch 的情况下，它是 CRAN page contains a link to the gzipped tarball of the source code. You can download this and use untar in R to review all the source code. Alternatively, many packages will have an easily-found repository on Github or other source-control sites where you can examine the source code via a browser. For example, you can browse the fGarch source on Github here.
For a package which was already published, is it possible to see and look into all files which were submitted? So like a repository as git where all files are submitted - the code itself and further files which are needed like description files or whatever - and I can see these files and look into them?
是的，您可以在非官方 Github CRAN 镜像 here
查看 Github 上上传到 CRAN 的所有包的所有源文件Is there code in a R package which I cannot see as an end user? This refers also to my previous question, how can I or which way can I see the whole code in a R package?
如上所述，您可以通过 CRAN 或 Github 获取任何包的源代码。如您所说，您只需在 R 中键入该函数的名称即可查看 exported 函数的源代码。对于未导出的函数，您可以使用三个冒号执行相同的操作。例如，ggplot2:::adjust_breaks 允许您从 ggplot2 中查看未导出函数 adjust_breaks 的函数体。当使用像 S4、ggproto 或 R6 这样的面向对象系统时，或者当源代码包含编译的 C 或 C++ 代码时，会有一些复杂性，但我还没有遇到过无法找到的情况一两分钟后使用 R 控制台和良好的搜索引擎获得相关源代码。