Plotly:如何从具有长格式或宽格式的 pandas 数据帧制作线图?

Plotly: How to make a line plot from a pandas dataframe with a long or wide format?

(这是一个自我回答 post 以帮助其他人缩短他们对 plotly 问题的回答,而不必解释 plotly 如何最好地处理长格式和宽格式的数据)


我想用尽可能少的行基于 pandas 数据框构建一个绘图图形。我知道您可以使用 plotly.express 来做到这一点,但是对于我称之为标准 pandas 数据帧的情况,这会失败;描述行顺序的索引,以及描述数据框中值名称的列名:

示例数据框:

    a           b           c
0   100.000000  100.000000  100.000000
1   98.493705   99.421400   101.651437
2   96.067026   98.992487   102.917373
3   95.200286   98.313601   102.822664
4   96.691675   97.674699   102.378682

一次尝试:

fig=px.line(x=df.index, y = df.columns)

这引发了一个错误:

ValueError: All arguments should have the same length. The length of argument y is 3, whereas the length of previous arguments ['x'] is 100`

您在这里尝试使用宽格式的 pandas 数据框作为 px.line 的来源。 plotly.express 旨在与 long format, often referred to as tidy data 的数据帧一起使用( 看看那个。没有人比 Wickham 更好地解释它)。许多人,尤其是那些因多年与 Excel 斗争而受伤的人,常常发现以宽格式组织数据更容易。那有什么区别呢?

宽幅面:

  • 数据与每个不同的数据变量一起显示在单独的列中
  • 每列只有一种数据类型
  • 缺失值通常用np.nan
  • 表示
  • 最适合与 plotly.graphobjects (go)
  • 通常使用 fid.add_traces()
  • 将线条添加到图形中
  • 颜色通常分配给每条轨迹

示例:

            a          b           c
0   -1.085631    0.997345   0.282978
1   -2.591925    0.418745   1.934415
2   -5.018605   -0.010167   3.200351
3   -5.885345   -0.689054   3.105642
4   -4.393955   -1.327956   2.661660
5   -4.828307    0.877975   4.848446
6   -3.824253    1.264161   5.585815
7   -2.333521    0.328327   6.761644
8   -3.587401   -0.309424   7.668749
9   -5.016082   -0.449493   6.806994

长格式:

  • 数据显示为一列包含所有值,另一列列出值的上下文
  • 缺失值根本不包含在数据集中。
  • 最适用于 plotly.express (px)
  • 颜色由默认颜色循环设置并分配给每个唯一变量

示例:

    id  variable    value
0   0   a        -1.085631
1   1   a        -2.591925
2   2   a        -5.018605
3   3   a        -5.885345
4   4   a        -4.393955
... ... ... ...
295 95  c        -4.259035
296 96  c        -5.333802
297 97  c        -6.211415
298 98  c        -4.335615
299 99  c        -3.515854

怎么走from wide to long?

df = pd.melt(df, id_vars='id', value_vars=df.columns[:-1])

下面的两个片段将产生完全相同的情节:

如何使用px绘制长数据?

fig = px.line(df, x='id', y='value', color='variable')

如何使用go绘制宽数据?

colors = px.colors.qualitative.Plotly
fig = go.Figure()
fig.add_traces(go.Scatter(x=df['id'], y = df['a'], mode = 'lines', line=dict(color=colors[0])))
fig.add_traces(go.Scatter(x=df['id'], y = df['b'], mode = 'lines', line=dict(color=colors[1])))
fig.add_traces(go.Scatter(x=df['id'], y = df['c'], mode = 'lines', line=dict(color=colors[2])))
fig.show()

从表面上看,go 更复杂并且提供了更多的灵活性?嗯,是。和不。您可以使用 px 轻松构建图形并添加您想要的任何 go 对象!

完整的代码片段:

import numpy as np
import pandas as pd
import plotly.express as px
import plotly.graph_objects as go

# dataframe of a wide format
np.random.seed(123)
X = np.random.randn(100,3)  
df=pd.DataFrame(X, columns=['a','b','c'])
df=df.cumsum()
df['id']=df.index

# plotly.graph_objects
colors = px.colors.qualitative.Plotly
fig = go.Figure()
fig.add_traces(go.Scatter(x=df['id'], y = df['a'], mode = 'lines', line=dict(color=colors[0])))
fig.add_traces(go.Scatter(x=df['id'], y = df['b'], mode = 'lines', line=dict(color=colors[1])))
fig.add_traces(go.Scatter(x=df['id'], y = df['c'], mode = 'lines', line=dict(color=colors[2])))
fig.show()

完整像素片段:

import numpy as np
import pandas as pd
import plotly.express as px
from plotly.offline import iplot

# dataframe of a wide format
np.random.seed(123)
X = np.random.randn(100,3)  
df=pd.DataFrame(X, columns=['a','b','c'])
df=df.cumsum()
df['id']=df.index

# dataframe of a long format
df = pd.melt(df, id_vars='id', value_vars=df.columns[:-1])

# plotly express
fig = px.line(df, x='id', y='value', color='variable')
fig.show()

我将把这个添加为答案,这样它就会成为证据。 首先感谢@vestland。这是一个反复出现的问题,所以解决这个问题很好,标记重复的问题可能更容易。

Plotly Express 现在接受宽格式和混合格式数据 你可以检查这个 post.

您可以更改 pandas 绘图后端以使用 plotly:

import pandas as pd
pd.options.plotting.backend = "plotly"

然后,要获得无花果,您只需写下:

fig = df.plot()

fig.show()显示上图。