将 Weka Fiji 插件细分导出为 ROI

Question

我正在使用 Imagej/Fiji Weka 插件对图像的不同区域进行分类，我想获得这些区域以进行进一步处理......（如 Rois？table 和类?)

所以最后我想获得每个分段的区域类..我需要编写此任务的脚本，因为它是管道的一部分......但不确定如何提取结果来自 Weka Imagej 插件…

实际上这个代码示例只是为了说明这个想法。有人有应用分类器和导出结果的基本示例吗？提前谢谢你

import trainableSegmentation.*;
import ij.IJ;
import ij.ImagePlus;

// input train image
input  = IJ.openImage( someImage.jpg" );

// create Weka Segmentation object
segmentator = new WekaSegmentation( input );

// load classifier from file
segmentator.loadClassifier( "classifier.model" );

result = segmentator.applyClassifier( input );
...

Answer 1

您在 image.sc 论坛中对此有几个答案：https://forum.image.sc/t/measuring-area-fraction-in-a-weka-classifed-image/7979 https://forum.image.sc/t/quantifing-weka-output/4660/6

也就是说，您也可以直接使用生成的标签图像在其他插件中进行测量，例如来自 MorphoLibJ 的插件（安装后，在插件 > MorphoLibJ > 分析下）。

将 Weka Fiji 插件细分导出为 ROI

Export Weka Fiji plugin segmentation as ROI

weka

imagej

fiji