如何在 gtsummary 包的 сharacteristic table 列中排序或更改行顺序?

How to sort or change rows order in a сharacteristic table column in the gtsummary package?

我正在尝试使用 tbl_summary () 中的函数 sort = list (stage ~ "alphanumeric ") 更改特性 table 列中的行顺序 trial[c("trt", "age", "stage", "grade")] %>% tbl_summary(by = trt, sort = list (grade ~ "alphanumeric"))。这是行不通的。 我想看看(例如:阶段 T3、T 4、T1、T2 和 III 级 -> I )

有 3 种方法可以控制 tbl_summary() 输出中出现的分类变量的顺序级别。

  1. 使用默认的字母数字排序(因子按其因子级别排序)

  2. 使用 tbl_summary(sort=) 参数按频率对输出进行排序。

  3. 通过定义因子变量并指定您希望输出显示的顺序来更改顺序。

以下示例适用于所有这些情况。我希望这回答了你的问题! 编码愉快!

library(tidyverse)
library(gtsummary)

# sorting by alphanumeric is the default
trial[c("trt", "stage")] %>% 
  tbl_summary(by = trt)

# sorting by frequency using the `sort=` argument
trial[c("trt", "stage")] %>% 
  tbl_summary(by = trt, sort = all_categorical() ~ "frequency")

# manually change the order in the dataset, before passing to `tbl_summary`
trial[c("trt", "stage")] %>% 
  mutate(stage = factor(stage, levels = c("T4", "T3", "T2", "T1"))) %>% 
  tbl_summary(by = trt)