在 rstudio 中提取 git 信息

Question

我正在尝试在 RStudio 和 Rmarkdown 中进行一些可重现的研究。主要是因为我懒得一遍又一遍地将数字粘贴到 powerpoint 或 word 中。 咧嘴一笑

我认为对于可重复研究非常重要的一件事是准确记录哪个版本的 RMarkdown 文档生成了报告。此类文档通常会经过多次修订，此外，它们可能会从存储库中提取多个其他源文件或数据。因此，插入 git 提交 SHA，并记录存储库是干净的还是脏的。

但是尽管 RStudio 知道 git，但它似乎无法通过任何 API 调用提供此信息。还是我遗漏了什么？

除了手动支付 git，我还有什么选择？

Answer 1

我认为 RStudio 也不提供此信息，但您可以通过这样的 system 调用轻松检索它，例如：

docVersion <- system("git log -n 1 --pretty=oneline", intern = TRUE)
repoStatus <- system("git status -s", intern = TRUE)

您只需要在 git log 中指定您想要的格式，也许 fiddle 稍微 git status 以获得您想要的确切信息。

Extracting git information in rstudio