docopt 不应用默认值

docopt doesn't apply default value

我有以下用法字符串:

    usage = """Usage: 
    counts_editing_precent_total_editing_to_csv.py out <output> files <pileupPercentFiles>... [--percentageField=<kn>] [--numReadsField=<kn>]
    counts_editing_precent_total_editing_to_csv.py -h | --help

Options:
     -h --help  show this screen.
     --percentageField=<kn>  the column of the percent field in the input file  [default: 7] .
     --numReadsField=<kn>  the column of the num of reads field in the input file  [default: 4] .

    """

然后我执行这段代码

    args = docopt(usage)
    print(args)

我运行以下命令:

python <filename>.py out a files a b c

输出为:

{'--help': False,
 '--numReadsField': None,
 '--percentageField': None,
 '-h': False,
 '<output>': 'a',
 '<pileupPercentFiles>': ['a', 'b', 'c'],
 'files': True,
 'out': True}

如您所见,未使用默认值。 我已经看到其他类似的问题,解决方案是“在命令和它的描述之间有两个空格”,我确保我有。 我真的无法区分我的示例与出现在 docs.

中的示例

我运行 它而且它有效。回想一下,您应该将用法字符串放在文件顶部的 from docopt import docopt 之前。这是一个重现它的脚本。

"""Usage:
    counts_editing_precent_total_editing_to_csv.py out <output> files <pileupPercentFiles>... [--percentageField=<kn>] [--numReadsField=<kn>]
    counts_editing_precent_total_editing_to_csv.py -h | --help

Options:
     -h --help  show this screen.
     --percentageField=<kn>  the column of the percent field in the input file  [default: 7] .
     --numReadsField=<kn>  the column of the num of reads field in the input file  [default: 4] .

"""
from docopt import docopt
ARGUMENTS = docopt(__doc__)
print(ARGUMENTS)