使用ggplotly将ggplot geom-tile转换为plotly图表的问题

Problem with ggplot geom-tile convert to plotly chartusing ggplotly

我尝试使用 ggplotly 函数将 ggplot geom-tile 图表转换为 plotly。然而,我意识到结果是不同的。请参考下面的 link 查看差异。除此之外,ggplotly 图表还缺少颜色条。请帮忙。

图片: Difference between ggplot and ggplotly chart

这是我参考的代码:https://www.r-graph-gallery.com/285-waffer-map.html

代码:

madeUp=read.table("https://raw.githubusercontent.com/holtzy/R-graph-gallery/master/DATA/madeUp.csv", sep=",", header=T)


library(tidyverse)


theData <- madeUp %>% 
  group_by(X.Axis, Y.Axis, Group) %>% 
  dplyr::summarize(statistic=mean(randVals, na.rm = TRUE))

fig <- ggplot(theData, aes(X.Axis, Y.Axis)) +

  coord_cartesian(xlim = c(0,20), ylim = c(0,20)) +
  scale_x_continuous(breaks = seq(0,20)) +
  scale_y_continuous(breaks = seq(0,20))+

  geom_tile(aes(fill=statistic))+
  guides(fill=guide_legend(title='Legend'))+

  theme(
    panel.background = element_rect(fill= 'white', color = 'white'),
    panel.grid.major = element_line(color='#E0E0E0'),
    panel.grid.minor = element_line(color='#E0E0E0')
  )+

  ggtitle('Wafer Map')+
  facet_wrap(~Group)+
  scale_fill_gradientn(colors = rainbow(100))

#Convert to ggplotly chart
fig <- ggplotly(fig)

谢谢

看起来您偶然发现了 ggplotly 中的一个(或两个)错误(也许您应该在 github 上提出问题)。

  1. 第一个问题是通过ggplotly.

  2. 转换ggplot时数据集中的"gaps"丢失了
  3. 第二个问题是ggplotly无法转换guides(fill=guide_legend(title='Legend'))添加的binned colorbar。

作为

的解决方法
  1. 第一期您可以扩展数据集以包含 X.AxisY.AxisGroup 的所有组合。
  2. 第二个问题,您可以删除合并的颜色条并将其替换为连续的色阶。

并不完美,但通过这种方式通过 ggplotly 进行转换可为您提供正确的情节和图例。试试这个:

madeUp=read.table("https://raw.githubusercontent.com/holtzy/R-graph-gallery/master/DATA/madeUp.csv", sep=",", header=T)

theData <- madeUp %>% 
  group_by(X.Axis, Y.Axis, Group) %>% 
  dplyr::summarize(statistic=mean(randVals, na.rm = TRUE)) %>% 
  ungroup()

# Expand the Dataset to includ all Combinations of X.Axis, Y.Axis and Group
theData1 <- tidyr::expand_grid(X.Axis = 0:49, Y.Axis = 0:30, Group = LETTERS[1:6]) %>% 
  dplyr::left_join(theData)

fig <- ggplot(theData1, aes(X.Axis, Y.Axis)) +
  coord_cartesian(xlim = c(0,20), ylim = c(0,20)) +
  scale_x_continuous(breaks = seq(0,20)) +
  scale_y_continuous(breaks = seq(0,20))+
  geom_tile(aes(fill=statistic))+
  # Remove the binned colorbar
  # guides(fill=guide_legend(title='Legend'))+
  labs(fill = "Legend") +
  theme(
    panel.background = element_rect(fill= 'white', color = 'white'),
    panel.grid.major = element_line(color='#E0E0E0'),
    panel.grid.minor = element_line(color='#E0E0E0')
  )+

  ggtitle('Wafer Map')+
  facet_wrap(~Group)+
  # in case of ggplot2: Set the fill color for NA to "transparent"
  scale_fill_gradientn(colors = rainbow(100), na.value = "transparent")
fig

ggplotly(fig)