如何使用 littler 的 install2.r 从 bioconductor 安装？
how to install from bioconductor using install2.r from littler?
我正在尝试使用 https://cran.r-project.org/web/packages/littler/vignettes/littler-examples.html#install2r:_With_Cmdline_Parsing to install some packages during which I get the error dependency 'graph' is not available. It appears that this package is available from Bioconductor project (https://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/graph.html) 但我不知道如何使用 install2.r.
安装它
那么，具体来说，我该如何使用 install2.r 安装 bioconductor 包？
你不能，因为 BioConductor 使用不同的存储库结构。
但是因为这是一个足够频繁的问题，我最近添加了一个您使用的帮助程序脚本 installBioc.r。要使用它，首先做
install.r littler BiocManager
确保我们拥有当前的 littler 版本以及我们需要的 BioC 包 BiocManager。然后使用例如
/usr/local/lib/R/site-library/littler/examples/installBioc.r S4Vectors
它将关闭并安装 BiocVersion、S4Vectors 以及
依赖项 BiocGenerics.
我正在尝试使用 https://cran.r-project.org/web/packages/littler/vignettes/littler-examples.html#install2r:_With_Cmdline_Parsing to install some packages during which I get the error dependency 'graph' is not available. It appears that this package is available from Bioconductor project (https://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/graph.html) 但我不知道如何使用 install2.r.
那么，具体来说，我该如何使用 install2.r 安装 bioconductor 包？
你不能，因为 BioConductor 使用不同的存储库结构。
但是因为这是一个足够频繁的问题，我最近添加了一个您使用的帮助程序脚本 installBioc.r。要使用它，首先做
install.r littler BiocManager
确保我们拥有当前的 littler 版本以及我们需要的 BioC 包 BiocManager。然后使用例如
/usr/local/lib/R/site-library/littler/examples/installBioc.r S4Vectors
它将关闭并安装 BiocVersion、S4Vectors 以及
依赖项 BiocGenerics.