从 numpy 数组创建图形顶点

Question

我有一个充满值的 numpy 数组，我想为数组中的每个点创建顶点。我正在使用 networkx 作为我的图形支持方法（此处的文档： http://networkx.github.io/documentation/latest/tutorial/ )

我想将数组中的每个元素都视为一个像素位置，并在每个位置创建一个顶点实例。使用简单的 for 循环很容易：

new=np.arange(16)
gnew=nx.Graph()
for x in new:
    if new[x]>0:
        gnew.add_node(x)
h=gnew.number_of_nodes()
print h

正如预期的那样，将打印 15 个节点。但是，当您具有相同的值时，这会变得更加棘手。例如：

new=np.ones(16)
gnew=nx.Graph()
for x in new:
    if new[x]>0:
        gnew.add_node(x)
h=gnew.number_of_nodes()
print h

现在，因为所有值都相同-(1)，所以只会将一个节点添加到图中。有办法绕过这个吗？

Answer 1

NetworkX 要求每个节点都有一个唯一的名称。您可以生成唯一的名称，然后将数组的元素设置为节点的属性，例如

new = np.ones(16);
othernew = np.arange(16)

G = nx.Graph()
for i in range(len(othernew)):
   if new[i]>0:
      G.add_node(othernew[i])
      G.node[othernew[i]]['pos'] = new[i] #This gives the node a position attribute with value new[i]

h = G.order()
print(h)

>>16

从 numpy 数组创建图形顶点

Creating graph vertices from numpy array

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