从宽到长:多列,两个时间点,两组

Wide to long: multiple columns, two timepoints, two groups

我已经搜索并找到了很多示例,到目前为止我还没有解决将我的数据从宽数据转换为长数据的问题。

以下是数据示例:

set.seed(12345)
id = 1:100
age = sample(1:100, 100, replace=TRUE)
group = sample(1:2, 100, replace=TRUE)
t0_var1 = sample(1:300, 100, replace=TRUE)
t2_var1 = sample(1:300, 100, replace=TRUE)
t0_var2 = sample(1:600, 100, replace=TRUE)
t2_var2 = sample(1:600, 100, replace=TRUE)
t0_var3 = sample(1:700, 100, replace=TRUE)
t2_var3 = sample(1:700, 100, replace=TRUE)

dataset = data.frame(id, age, group, t0_var1, t2_var1, t0_var2, t2_var2, t0_var3, t2_var3)

head(dataset)
  id age group t0_var1 t2_var1 t0_var2 t2_var2 t0_var3 t2_var3
1  1  73     1     177      16      46     126     490     431
2  2  88     2     268     180     285     460       8     250
3  3  77     2      38     213     159     505     353     326
4  4  89     2     154     197     139     561     512     210
5  5  46     2     200     174     358     406     231      50
6  6  17     2     230     204      96     516     575     506

我需要按如下方式排列列:

id | age | group | assessment | var1 | var2 | var3
1  | 23    1       1            12     34     64
1  | 23    1       2            34     14     68
2  | 43    2       1            22     44     54
2  | 43    2       2            34     54     88
...

我尝试了不同的方法,但我一次只能设法转换两列。
预先感谢您的帮助。

来自 Ben 的评论:

pivot_longer(dataset, cols = -c(id, age, group), names_to = c("assessment", ".value"), names_pattern = "t(\d+)_(\w+)")

# A tibble: 200 x 7
      id   age group assessment  var1  var2  var3
   <int> <int> <int> <chr>      <int> <int> <int>
 1     1    14     1 0            287     1   280
 2     1    14     1 2            266     5   523
 3     2    51     2 0            136   456   444
 4     2    51     2 2             66   292   260
 5     3    80     1 0            111   263   635
 6     3    80     1 2            275   255    70
 7     4    90     1 0            174   438   212
 8     4    90     1 2            161   161   694
 9     5    92     1 0             86   184   595
10     5    92     1 2            176   399    32

正则表达式t(\d+)_(\w+)表示:

  • 查找 1 个或多个数字:字母“t”后的“\d+”。
  • 那么应该有个下划线“_”
  • 然后寻找1个或多个单词字符:"\w+"
  • 现在检索“( )”所包含的部分

因此,此问题的 return 值将是“t”后面的数字(例如 0 或 2),然后是列名的后缀(例如 var1、var2、var3)

我们可以使用 melt 来自 data.table

library(data.table)
melt(setDT(dataset), measure = patterns("var1$", "var2$", "var3$"), 
    value.name = paste0("var", 1:3))