意外标记 `fi` 附近的语法错误 - Linux

Question

我在 Windows 中使用 WSL (Ubuntu)。我在下面的脚本中使用了 bash script.sh：

    #! /bin/sh
#################LOAD FILES###################
lead_SNPs=`grep "lead_SNPs" ../prep/files.txt | cut -f2`
bfile=`grep -w "bfile" ../prep/files.txt | cut -f2`
bfile_list=`grep -w "bfile_list" ../prep/files.txt | cut -f2`
r2=`grep "r2" ../prep/parameters.txt | cut -f2`
###############LD###########################
if [ ${bfile} = "NA" ]; then
    cat ${bfile_list} | while read line; do 
    file=${line}
    file_n=`echo $file |awk -F '/' '{print $NF}'`

    echo 'Calculating LD'
    plink --bfile ${file} --r2  --ld-window-kb 1000 --ld-window 999999 --ld-window-r2 ${r2} --ld-snp-list ${lead_SNPs} --out C:/Users/naghm/Desktop/FDSP-github/ld/${file_n}

    done
else
    file=${bfile}
    file_n=`echo $file |awk -F '/' '{print $NF}'`
    echo ${file_n}
    plink --bfile ${file} --r2  --ld-window-kb 1000 --ld-window 999999 --ld-window-r2 ${r2} --ld-snp-list ${lead_SNPs} --out C:/Users/naghm/Desktop/FDSP-github/ld/${file_n}
fi

但是我收到这个错误

Syntax error near unexpected token `fi`

你能更正我的代码吗？我不明白我哪里弄错了。

Answer 1

尝试改变：

if [ ${bfile} = "NA" ]; then

到

if [ "${bfile}" = "NA" ]; then

我怀疑 ${bfile} 是空的，扩展为：

if [  = "NA" ]; then

在您的原始行中。

Answer 2

您脚本的第一行看起来不正确。应该是

#!/bin/sh

或者如果使用 bash shell:

#!/bin/bash

意外标记 `fi` 附近的语法错误 - Linux

Syntax error near unexpected token `fi` - Linux

linux

bash

windows-subsystem-for-linux