R 包未检测到 GDAL 的更新版本

Question

我正在尝试从 raster 转移到新的 terra R 包，这需要在我的机器上安装最新版本的 GDAL (MacOS 10.14.6)。

我按照此处的说明更新了 GDAL：http://www.alexchubaty.com/post/2020-01-08-using-latest-gdal-macos-redux/，它似乎有效。当我在终端显示运行 gdalinfo --version 时：

GDAL 3.1.1, released 2020/06/22

但是当我在 R 中加载 terra 库时，它似乎仍然 link 到旧版本的 GDAL (2.4.2):

> library(terra)
This is terra version 0.7.11 (alpha-release)

NOTE: You are using GDAL version 2.4.2 
For full functionality you need at least version 3.0.4

有趣的是，rgdal 包似乎检测到更新版本：

> library(rgdal)
Loading required package: sp
rgdal: version: 1.5-12, (SVN revision 1018)
Geospatial Data Abstraction Library extensions to R successfully loaded
Loaded GDAL runtime: GDAL 3.1.2, released 2020/07/07
Path to GDAL shared files: /usr/local/Cellar/gdal/3.1.2/share/gdal
GDAL binary built with GEOS: TRUE 
Loaded PROJ runtime: Rel. 7.1.0, August 1st, 2020, [PJ_VERSION: 710]
Path to PROJ shared files: /Users/jamesmccarthy/Library/Application Support/proj:/usr/local/opt/proj/share/proj:/usr/local/Cellar/proj/7.1.0/share/proj
PROJ CDN enabled:FALSE
Linking to sp version:1.4-2
To mute warnings of possible GDAL/OSR exportToProj4() degradation,
use options("rgdal_show_exportToProj4_warnings"="none") before loading rgdal.

Attaching package: ‘rgdal’

The following object is masked from ‘package:terra’:

    project

有谁知道如何获取 terra 到 link 最新版本的 GDAL？我猜旧版本仍然安装在机器上的某个地方。

Answer 1

我猜您是从源代码安装的 rgdal，但是 terra 的 二进制版本 来自 CRAN。因此，在从命令行执行（您已经执行的操作）之后：

brew install pkg-config
brew install gdal

您应该使用以下 R 命令得到您想要的东西

install.packages("terra", type = "source")

或者，对于切削刃

remotes::install_github("rspatial/terra")

祝你 terra 好运！

R 包未检测到 GDAL 的更新版本

R package doesn't detect updated version of GDAL

r

gdal

rgdal

r-raster