rcpp 中没有调用的匹配函数

Question

当使用 Rcpp 时，我创建了一个名为 rpois_rcpp 的函数，我尝试在下面的 genDataList 函数中调用它，出现错误并说： “没有用于调用 'cpprbinom' 的匹配函数，候选函数不可行：对于第三个参数，没有已知的从 'arma::vec'（又名 'Col'）到 'Rcpp::NumericVector'（又名 'Vector<14>'）的转换 arma::vec cpprbinom（整数 n，双倍大小，NumericVector 概率）。

谁能帮帮我，谢谢！

这是我的代码：

//create a random matrix X with covariance matrix sigma
// [[Rcpp::export]]
arma::mat mvrnormArma(const int n, arma::vec mu, const int p, const 
double rho) {

  arma::mat sigma(p, p, arma::fill::zeros);

  for (int i = 0; i < sigma.n_rows; ++i) {
    for (int j = 0; j < sigma.n_cols; ++j) {
      sigma(i,j) = pow(rho, abs((i + 1) - (j + 1)));
    }
  }

  int ncols = sigma.n_cols;
  arma::mat Y = arma::randn(n, ncols);


  return arma::repmat(mu, 1, n).t() + Y * arma::chol(sigma);
}

//create a vector sampled from poisson distribution with mean vector 
//lambda
// [[Rcpp::export]]
arma::vec rpois_rcpp( NumericVector &lambda) {
  int n= lambda.length();
  unsigned int lambda_i = 0;
  IntegerVector sim(n);
  for (unsigned int i = 0; i < n; i++) {
    sim[i] = R::rpois(lambda[lambda_i]);
    // update lambda_i to match next realized value with correct mean
    lambda_i++;

  }
  return  as<arma::vec>(sim);
}

//create a vector sampled from binomial distribution with probability 
vector prob
// [[Rcpp::export]]
arma::vec cpprbinom(int n, double size, NumericVector prob) { 
  NumericVector v = no_init(n);
  std::transform( prob.begin(), prob.end(), v.begin(), [=](double p){ 
      return R::rbinom(size, p); }); 
  return as<arma::vec>(v);}




// [[Rcpp::export]]44
List genDataList(int n, arma::vec& mu, int p, double rho,
             arma::vec& beta, const double SNR, const std::string & 
  Test_case) {

  arma::mat U, V, data, normData, Projection;
  arma::vec s, y, means, noise;

  data = mvrnormArma(n, mu, p, rho);
  normData = arma::normalise(data,2,0);
  arma::svd_econ(U,s,V,normData,"right");
  Projection = V * trans(V);
  beta = Projection * beta;


  if(Test_case == "gaussian")
  {
    means=normData * beta;
    y = means + arma::randn(n) * sqrt(arma::var(means) / SNR);}
  else if (Test_case == "poisson")
  {
    means=exp(normData * beta);
    y = rpois_rcpp(means);}
  else
  {
    means=exp(normData * beta)/(1 + exp(normData * beta));
    y = cpprbinom(n,1,means);}




  List ret;
  ret["data"] = data;
  ret["normData"] = normData;
  ret["V"] = V;
  ret["beta"] = beta;
  ret["y"] = y;
  return ret;

  }

Answer 1

感谢您添加代码。当我试图编译时，我得到了和你一样的错误，但是还有调用 rpois_rcpp()

行的错误

invalid initialization of reference to type 'Rcpp::NumericVector&'

几乎所有东西似乎都在 arma 中，除了 R 绑定和对 R:: 命名空间的调用，它需要双精度数、整数等。这似乎是最简单的事情（到我的想法），只是将 arma::vec 作为参数：

arma::vec rpois_rcpp( arma::vec &lambda) {
    int n= lambda.n_elem;

和

    arma::vec cpprbinom(int n, double size, arma::vec prob) {

你永远不会利用 lambda 和 prob 是 Rcpp::NumericVector 的事实，你只是使用它们的 double，所以这似乎是最简单的方法我。在这些更改之后，您的代码在我的机器上可以正常编译。我没有任何测试用例来确保它们运行正如您所期望的那样，但我想它们会。

rcpp 中没有调用的匹配函数

no matching function for call in rcpp

c++

r

rcpp