是否可以调整 ggrraph 中的相对节点大小？

Question

新 R；在 with reprex.

的帮助下尽力呈现我的问题

我有一个节点大小按度数排列的网络，使用 ggraph 包。

绘制的网络看起来不太好，因为一些节点非常小。

我想增加节点的相对大小。

在 igraph 中，我会增加节点的相对大小，例如：

plot(df, vertex.cex=degree*5)

我在 ggraph 中尝试过类似的东西（在下面的 rerpex 中），但结果是度值的乘积，而不是相对增加节点大小。

我想坚持使用 ggraph 包，如果只是因为 tidy/grammar 方法并管理（哦，非常陡峭的）学习曲线（尽管我可以说服其他人，如果有人对这两个包有一些想法）。

下面的例子没有附图，因为我的声望不够高post 图片。但如果我做对了，reprex 应该会做它应该做的事情。

#load libraries
library(tidygraph)
#> 
#> Attaching package: 'tidygraph'
#> The following object is masked from 'package:stats':
#> 
#>     filter
library(ggraph)
#> Loading required package: ggplot2
# Creating a data frame
df <- rbind(c(0,1,1,0,0,1,1,0,1),
            c(0,0,1,1,0,0,1,1,0),
            c(0,1,0,0,0,0,1,0,0),
            c(0,0,0,0,0,1,0,1,0),
            c(0,0,1,0,0,1,0,1,0),
            c(0,0,1,0,0,1,1,1,0),
            c(1,0,1,1,0,1,0,1,0),
            c(0,1,0,0,0,0,0,0,1),
            c(0,1,0,0,0,1,1,0,1))
# convert to matrix
df <- as.matrix(df) #convert to matrix df; columns as headings is part of the function
# convert to tbl_graph
df <- as_tbl_graph(df)

# plot network; nodes sized by degree; nodes too small
df %>% 
  mutate(degree = centrality_degree()) %>% 
  ggraph(layout = 'kk') + 
  geom_node_point(aes(size = degree))+
  geom_edge_link()

# tried multiplying degree by a value as below; changes the 
# value of the degrees and leaves node size unchanged.
df %>% 
  mutate(degree = centrality_degree()) %>% 
  ggraph(layout = 'kk') + 
  geom_node_point(aes(size = 2*degree))+
  geom_edge_link()

^{由 reprex package (v0.3.0)}

于 2020-07-18 创建

Answer 1

我已经找到了一个解决方案，看看这个 link：Network Visualizations in R

关键是在您的情节的管道中添加 scale_size_continuous。我试过这个选项：

df %>% 
  mutate(degree = centrality_degree()) %>% 
  ggraph(layout = 'kk') + 
  geom_node_point(aes(size = degree)) +
  scale_size_continuous(range = c(2, 5)) +
  geom_edge_link()

是否可以调整 ggrraph 中的相对节点大小？

Is it possible to resize the relative node size in ggrraph?

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