如何将 Rmarkdown 文件转换为工作乳胶文件

Question

我写了一篇手稿，我想提交给 Rmarkdown 的期刊。该期刊接受 word 和乳胶文件，所以我正在寻找一种方法来从我的 .Rmd 文件中生成一个工作 .tex 文件。

我读过一些 post 暗示这是可能的（例如），这对我有所帮助，但我仍然遇到问题。

例如，使用上面 post 中提到的方法，我可以将测试 .Rmd 转换为具有 .tex 文件类型的文件。这是测试 Rmarkdown（只是新文件的常用模板）：

---
title: "Test document"
author: "Me"
date: "23 7 2020"
output: pdf_document
---

```{r setup, include=FALSE}
knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE)
```

## R Markdown

This is an R Markdown document. Markdown is a simple formatting syntax for authoring HTML, PDF, and MS Word documents. For more details on using R Markdown see <http://rmarkdown.rstudio.com>.

When you click the **Knit** button a document will be generated that includes both content as well as the output of any embedded R code chunks within the document. You can embed an R code chunk like this:

```{r cars}
summary(cars)
```

## Including Plots

You can also embed plots, for example:

```{r pressure, echo=FALSE}
plot(pressure)
```

Note that the `echo = FALSE` parameter was added to the code chunk to prevent printing of the R code that generated the plot.

这可以正常编译为 PDF。然后，在控制台中我运行:

knitr::knit("test.Rmd")

在我的工作目录中获取降价文件 test.md，然后我显然可以使用

将此 .md 文件转换为 .tex

rmarkdown::pandoc_convert("test.md", to = "latex", output = "test.tex")

这会生成一个 .tex 文件，当我双击它时，会弹出该文件的 PDF 视图，看起来不错。不过看一下文件，它是不完整的，或者至少对我来说是陌生的：

\hypertarget{r-markdown}{%
\subsection{R Markdown}\label{r-markdown}}

This is an R Markdown document. Markdown is a simple formatting syntax
for authoring HTML, PDF, and MS Word documents. For more details on
using R Markdown see \url{http://rmarkdown.rstudio.com}.

When you click the \textbf{Knit} button a document will be generated
that includes both content as well as the output of any embedded R code
chunks within the document. You can embed an R code chunk like this:

\begin{Shaded}
\begin{Highlighting}[]
\KeywordTok{summary}\NormalTok{(cars)}
\end{Highlighting}
\end{Shaded}

\begin{verbatim}
##      speed           dist       
##  Min.   : 4.0   Min.   :  2.00  
##  1st Qu.:12.0   1st Qu.: 26.00  
##  Median :15.0   Median : 36.00  
##  Mean   :15.4   Mean   : 42.98  
##  3rd Qu.:19.0   3rd Qu.: 56.00  
##  Max.   :25.0   Max.   :120.00
\end{verbatim}

\hypertarget{including-plots}{%
\subsection{Including Plots}\label{including-plots}}

You can also embed plots, for example:

\begin{figure}
\centering
\includegraphics{figure/pressure-1.png}
\caption{plot of chunk pressure}
\end{figure}

Note that the \texttt{echo\ =\ FALSE} parameter was added to the code
chunk to prevent printing of the R code that generated the plot.

据我所知，它缺少序言 \begin{document}、\end{document}，而且我不知道 hypertarget 部分的 hypertarget 位是怎么回事 headers。毫不奇怪，当我在 MiKTeX 中点击运行时，它不会“re-compile”。不过，代码块的 verbatim 位看起来正是我所追求的。

那么，有没有一种方法可以生成从 .Rmd 文件编译而来的 .tex 文件？还是我必须手动编写序言之类的？如果我的问题的答案是“阅读 pandoc”，那么很公平，我将不得不硬着头皮最后看一看。但是我很难想象在Rmarkdown中没有好的（简单的）方法来准备可提交的手稿。

Answer 1

Pandoc 默认生成 LaTeX 片段，即不是完整文档。这可以通过使用 --standalone 选项调用 pandoc 来更改：

rmarkdown::pandoc_convert(
  "test.md",
  to = "latex",
  output = "out.tex",
  options = "--standalone"
)

您可以让 R 完成工作并将您的命令缩短为

render("test.Rmd", output_format = "latex_document")

感兴趣的项目可能是 rticles。

如何将 Rmarkdown 文件转换为工作乳胶文件

How to convert Rmarkdown file to working latex file

latex

pandoc

r-markdown