Python 打包：在 `conda` `meta.yaml` 文件中创建对 `conda-forge` 包的依赖

Question

我正在为 conda-forge 编写一个包，需要指定对另一个 conda-forge 依赖项的依赖项。本质上，我需要安装 conda-forge gdal 包的固定版本，因为它实际上编译了支持 BIGTIFF 文件的 libtiff 版本....

现在，如果我将 gdal 安装到 conda 环境中，我会写类似的东西。

conda install -c conda-forge gdal=2.4.4

我会在安装软件包时从 conda-forge 中安装此版本的 gdal=2.4.4。现在在 meta.yaml 文件中，我可以像这样指定包依赖项，但我没有看到如何将 URL 指定到 tar 文件，或者任何可行的方法。

{% set version = "0.0.1" %}

package:
  name: mypackage
  version: {{ version }}

source:
  url: https://github.com/myrepo/{{ version }}.tar.gz
  sha256: ****6a63

build:
  number: 1
  skip: true  # [win and py27]
  entry_points:
    - mycli = mypackage.main:main

requirements:
  build:
    - python
    - 
  host:
    - python
    - pip
    - numpy
    - gdal  # <----- want to specify from conda-forge
  run:
    - python
    - gdal  # <----- want to specify from conda-forge

如有任何关于如何执行此操作的建议，我们将不胜感激。

Answer 1

我认为无法在 meta.yaml 中指定频道。以下问题在 conda-build 问题跟踪器中仍未解决： https://github.com/conda/conda-build/issues/532

作为解决方法，如果您知道所需 gdal 的确切版本，则可以在配方中指定确切的版本和“构建字符串”。

唯一烦人的是，您必须为您的食谱需要支持的每种平台和 python 版本组合列出一次 gdal。

requirements:
  build:
    - python
    - 
  host:
    - python
    - pip
    - numpy
    - gdal  2.4.4 py36h02fde04_1  # [osx and py==36]
    - gdal  2.4.4 py37h622575a_1  # [osx and py==37]
    - gdal  2.4.4 py38h57202bd_1  # [osx and py==38]
    - gdal  2.4.4 py36hbb8311d_1  # [linux and py==36]
    - gdal  2.4.4 py37hf8c3989_1  # [linux and py==37]
    - gdal  2.4.4 py38hfe926b7_1  # [linux and py==38]

  run:
    - python
    - gdal  2.4.4 py36h02fde04_1  # [osx and py==36]
    - gdal  2.4.4 py37h622575a_1  # [osx and py==37]
    - gdal  2.4.4 py38h57202bd_1  # [osx and py==38]
    - gdal  2.4.4 py36hbb8311d_1  # [linux and py==36]
    - gdal  2.4.4 py37hf8c3989_1  # [linux and py==37]
    - gdal  2.4.4 py38hfe926b7_1  # [linux and py==38]

（我从 gdal package listing on the conda-forge channel 复制了那些。）

顺便说一句，既然你提到对你来说真正重要的区别是 libtiff，那么你应该固定 libtiff 而不是 gdal 吗？或者两者都有？

编辑：

最好避免在 host 和 run 部分重复整个构建字符串列表。

正如您在评论中所建议的，一种选择是在 conda_build_config.yaml:

中定义构建字符串

# conda_build_config.yaml
gdal_build:
  - py36h02fde04_1  # [osx and py==36]
  - py37h622575a_1  # [osx and py==37]
  - py38h57202bd_1  # [osx and py==38]
  - py36hbb8311d_1  # [linux and py==36]
  - py37hf8c3989_1  # [linux and py==37]
  - py38hfe926b7_1  # [linux and py==38]

# meta.yaml
requirements:
  build:
    - python
    - 
  host:
    - python
    - pip
    - numpy
    - gdal  2.4.4 {{ gdal_build }}

  run:
    - python
    - gdal  2.4.4 {{ gdal_build }}

另一种选择是在 jinja 变量中直接在 meta.yaml 中定义查找 table。这可能有点丑陋，但至少所有逻辑都包含在一个文件中。我不确定该选哪个。

{% set platform = 'linux' if linux else 'osx' if osx else 'win' %}

{%
  set gdal_builds = {
    'osx': {
      36: 'py36h02fde04_1',
      37: 'py37h622575a_1',
      38: 'py38h57202bd_1',
    },
    'linux': {
      36: 'py36hbb8311d_1',
      37: 'py37hf8c3989_1',
      38: 'py38hfe926b7_1',
    }
  }
%}

requirements:
  build:
    - python
    - 
  host:
    - python
    - pip
    - numpy
    - gdal  2.4.4 {{ gdal_builds[platform][py] }}

  run:
    - python
    - gdal  2.4.4 {{ gdal_builds[platform][py] }}

Python 打包：在 `conda` `meta.yaml` 文件中创建对 `conda-forge` 包的依赖

Python Packaging: Creating a dependency on a `conda-forge` package in `conda` `meta.yaml` file

python

gdal

conda

conda-build

conda-forge