如何编译需要 HDF5 库的程序（使用 Codeblocks）？

Question

我有 11 个文件都需要 HDF5 库。通常我只是使用另一种方法来编译和构建该程序。现在我改变主意了，我想自己用 Codeblocks 来做。

这是问题所在：

我在代码块中打开项目中的 'build option'。然后我直接跳转到链接器设置。并添加需要的.a库文件。
然后我直接点击'rebuild workspace'。

此处出现错误信息：

gfortran -Jobj/Debug/ -Wall  -g  -O3    -c "/home/shawn/Documents/datafile_oldubuntu/Academics/Data_analysis_code/Helmholtz decomposition+rotcombudget/code_budget/budget_helmholtz_comrot_ver2.0_symmertic/global.f90" -o obj/Debug/global.o

/home/shawn/Documents/datafile_oldubuntu/Academics/Data_analysis_code/Helmholtz decomposition+rotcombudget/code_budget/budget_helmholtz_comrot_ver2.0_symmertic/global.f90:3.4:

USE HDF5
    1

Fatal Error: Can't open module file 'hdf5.mod' for reading at (1): No such file or directory
Process terminated with status 1 (0 minute(s), 1 second(s))
1 error(s), 0 warning(s) (0 minute(s), 1 second(s))

如你所见，我的编译文件夹本地没有hdf5.mod这个东西。所以这意味着代码块中的链接器选项不起作用。为什么？

Answer 1

编译时需要依赖项 hdf5.mod，而不是 link 时，这就是为什么您无法通过 linker 选项成功修复它的原因。模块文件在概念上有点像 C 包含文件（尽管在实现上有很大不同并且不可移植）。为了让编译器找到它们，您可以通过 -I 选项传递搜索路径。

在代码块中，您应该在 linker 选项旁边找到一个 search directories 选项卡（在项目构建选项中）。在搜索目录选项卡中，您需要 select 编译器选项卡，然后将路径添加到 hdf5 模块文件。

Answer 2

还要确保您已经安装了 serial hdf5 库包。这可能会在将来帮助其他人。

在 Ubuntu:

sudo apt-get install libhdf5-serial-dev

我收到了与您相同的错误，因为我只有 MPI 版本（libhdf5-openmpi-dev 或 libhdf5-mpich-dev）

在 MacOS 上：

您可能需要 some/all 个 Fortran 标志：

brew install homebrew/science/hdf5 --with-fortran --with-mpi --with-fortran2003

如何编译需要 HDF5 库的程序（使用 Codeblocks）？

How to compile a program that need HDF5 library (using Codeblocks)?

fortran

codeblocks