R: Error: $ operator not defined for this S4 class when using RadAR package
R: Error: $ operator not defined for this S4 class when using RadAR package
我正在尝试可视化使用放射组学从 CT 扫描数据集中提取的特征。我使用 Pyradiomics 库提取了特征，现在我有几个 .csv 个文件。
我找到了 this R 库，它可以读取数据集并为其生成图像。使用 input = import_pyradiomics(dir = "/path/to/datadir") 命令按计划读取数据集，但是当我尝试使用 plot_correlation_matrix(rdr = input, view_as = "heatmap") 等可视化函数之一对其进行可视化时，出现以下错误：
Error: $ operator not defined for this S4 class
我阅读了有关 S3 和 S4 classes 的信息，我认为库中的 [line 160] 是此错误首先发生的地方，因为它试图调用此“$”运算符。我目前使用的是 R 版本 4.0.2。在我看来，这个问题是由依赖旧版本 R 的 R 库引起的，但它相对较新。我该怎么做才能解决这个问题？是不是必须进去手动改库里的代码？或者是否有更简单的修复方法，例如将 S4 class 转换为 S3 class？我觉得我缺少一个简单的解决方案，因为我不熟悉 R。
我发现了一个类似的问题 ，但它没有回答我的具体问题。不幸的是，有关此主题的其他问题的答案也不适合我。
我是 RadAR 的开发者，感谢您对我们的软件包感兴趣。该问题可能与使用不同版本的 SummarizedExperiment R 包有关。该错误现已修复。您可以 re-install 来自 https://github.com/cgplab/RadAR 的新版 RadAR。
有关 RadAR 的任何问题，请参阅 RadAR github 页面的“问题”部分。
我正在尝试可视化使用放射组学从 CT 扫描数据集中提取的特征。我使用 Pyradiomics 库提取了特征，现在我有几个 .csv 个文件。
我找到了 this R 库，它可以读取数据集并为其生成图像。使用 input = import_pyradiomics(dir = "/path/to/datadir") 命令按计划读取数据集，但是当我尝试使用 plot_correlation_matrix(rdr = input, view_as = "heatmap") 等可视化函数之一对其进行可视化时，出现以下错误：
Error: $ operator not defined for this S4 class
我阅读了有关 S3 和 S4 classes 的信息，我认为库中的 [line 160] 是此错误首先发生的地方，因为它试图调用此“$”运算符。我目前使用的是 R 版本 4.0.2。在我看来，这个问题是由依赖旧版本 R 的 R 库引起的，但它相对较新。我该怎么做才能解决这个问题？是不是必须进去手动改库里的代码？或者是否有更简单的修复方法，例如将 S4 class 转换为 S3 class？我觉得我缺少一个简单的解决方案，因为我不熟悉 R。
我发现了一个类似的问题
我是 RadAR 的开发者，感谢您对我们的软件包感兴趣。该问题可能与使用不同版本的 SummarizedExperiment R 包有关。该错误现已修复。您可以 re-install 来自 https://github.com/cgplab/RadAR 的新版 RadAR。 有关 RadAR 的任何问题，请参阅 RadAR github 页面的“问题”部分。