加载 gdata 包时如何修复 Perl 警告消息？

Question

我更新了 Strawberry Perl 64-bit 5.30.2001 和 gdata 包。现在，在加载 library(gdata) 时，我总是收到似乎与 Perl 相关的警告消息。

suppressPackageStartupMessages(library(gdata))
# Warning messages:
#   1: In system(cmd, intern = intern, wait = wait | intern, show.output.on.console = wait,  :
#     running command 'C:\Windows\system32\cmd.exe /c ftype perl' had status 2
#   2: In system(cmd, intern = intern, wait = wait | intern, show.output.on.console = wait,  :
#     running command 'C:\Windows\system32\cmd.exe /c ftype perl' had status 2

不过read.xls，我需要的功能，好像运行不错，就是每次用的时候都会重复警告

read.xls("http://file-examples-com.github.io/uploads/2017/02/file_example_XLS_10.xls")
# trying URL 'http://file-examples-com.github.io/uploads/2017/02/file_example_XLS_10.xls'
# Content type 'application/vnd.ms-excel' length 8704 bytes
# downloaded 8704 bytes

#   X0 First.Name Last.Name Gender       Country Age       Date   Id
# 1  1      Dulce     Abril Female United States  32 15/10/2017 1562
# 2  2       Mara Hashimoto Female Great Britain  25 16/08/2016 1582
# 3  3     Philip      Gent   Male        France  36 21/05/2015 2587
# 4  4   Kathleen    Hanner Female United States  25 15/10/2017 3549
# 5  5    Nereida   Magwood Female United States  58 16/08/2016 2468
# 6  6     Gaston     Brumm   Male United States  24 21/05/2015 2554
# 7  7       Etta      Hurn Female Great Britain  56 15/10/2017 3598
# 8  8    Earlean    Melgar Female United States  27 16/08/2016 2456
# 9  9   Vincenza   Weiland Female United States  40 21/05/2015 6548
# Warning messages:
#   1: In system(cmd, intern = intern, wait = wait | intern, show.output.on.console = wait,  :
#     running command 'C:\Windows\system32\cmd.exe /c ftype perl' had status 2
#   2: In system(cmd, intern = intern, wait = wait | intern, show.output.on.console = wait,  :
#     running command 'C:\Windows\system32\cmd.exe /c ftype perl' had status 2

我不确定如何处理这个警告，因为它对我没有任何意义，我可能只是忽略它并用 suppressWarnings() 包围它。

不过，有人知道解决这个问题的方法吗？我无法通过谷歌搜索找到任何东西，也不知道从哪里开始，也不知道到底出了什么问题。

> sessionInfo()
R version 4.0.2 (2020-06-22)
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
Running under: Windows 7 x64 (build 7601) Service Pack 1

Matrix products: default

locale:
[1] LC_COLLATE=English_United States.1252 
[2] LC_CTYPE=English_United States.1252   
[3] LC_MONETARY=English_United States.1252
[4] LC_NUMERIC=C                          
[5] LC_TIME=English_United States.1252    

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

other attached packages:
[1] gdata_2.18.0

loaded via a namespace (and not attached):
[1] compiler_4.0.2 tools_4.0.2    gtools_3.8.2

Answer 1

我在新安装的 R、gdata 和 Strawberry Perl 版本中遇到了同样的问题。我终于找到 this answer 一个不同的（但相关的）问题。根据那里的建议，我运行在 elevated 命令提示符上执行以下操作：

FTYPE perl=C:\Strawberry\perl\bin\perl.exe %1 %*

这为我解决了问题 – 但是：我不确定像这样设置 FTYPE 是否会产生任何不良副作用。所以要小心。

更新：上面的命令确实为我抑制了警告“ftype perl' had status 2”，但是 gdata 仍然有问题：

gdata: Unable to load perl libaries needed by read.xls() gdata: to support 'XLSX' (Excel 2007+) files.

gdata: Run the function 'installXLSXsupport()' gdata: to automatically download and install the perl gdata: libaries needed to support Excel XLS and XLSX formats.

但是，installXLSXsupport() 失败并出现了不明确的错误消息。

然后我运行

Sys.which("perl")
                              perl 
"C:\rtools40\usr\bin\perl.exe"

并意识到来自 RTools 的 Perl 版本优先于我安装的 Strawberry Perl – 显然 gdata 不“喜欢”那个 Perl 版本。

因此，我决定通过更改 .Renviron 文件 (usethis::edit_r_environ()):

让 Strawberry Perl 优先于 RTools

PATH="${RTOOLS40_HOME}\usr\bin;${PATH}" # old
PATH="${PATH};${RTOOLS40_HOME}\usr\bin" # new

同样，我不完全确定这个可能有什么后果，但它为我解决了 gdata。也许单独调整 PATH 也可以解决问题（没有我先做的 ftype 特技），但我不能再测试了。

我的推荐：

先调整PATH。
如果 gdata 仍然抱怨 ftype，请设置 ftype。

加载 gdata 包时如何修复 Perl 警告消息？

How to fix Perl warning message when loading gdata package?

windows

perl

xls

r

gdata