Apache Spark 无法处理大型 Cassandra 列族
Apache Spark fails to process a large Cassandra column family
我正在尝试使用 Apache Spark 来处理我的大型(~230k 条目)cassandra 数据集,但我经常 运行 遇到各种错误。但是,当 运行 对数据集 ~200 个条目进行 运行 应用时,我可以成功 运行 应用程序。我有一个包含 3 个节点的 spark 设置,其中有 1 个主节点和 2 个工作节点,这 2 个工作节点还安装了一个 cassandra 集群,其数据索引的复制因子为 2。我的 2 个 spark 工作节点在 Web 界面上显示了 2.4 和 2.8 GB 的内存,并且我在 运行 应用程序时将 spark.executor.memory
设置为 2409,以获得 4.7 GB 的组合内存。这是我的 WebUI 主页
其中一项任务的环境页面
现阶段,我只是尝试使用 spark 处理存储在 cassandra 中的数据。这是我在 Java
中用来执行此操作的基本代码
SparkConf conf = new SparkConf(true)
.set("spark.cassandra.connection.host", CASSANDRA_HOST)
.setJars(jars);
SparkContext sc = new SparkContext(HOST, APP_NAME, conf);
SparkContextJavaFunctions context = javaFunctions(sc);
CassandraJavaRDD<CassandraRow> rdd = context.cassandraTable(CASSANDRA_KEYSPACE, CASSANDRA_COLUMN_FAMILY);
System.out.println(rdd.count());
对于一个成功的 运行,在一个小数据集(200 个条目)上,事件界面看起来像这样
但是当我 运行 在大型数据集上做同样的事情时(即我只更改 CASSANDRA_COLUMN_FAMILY
),作业永远不会在终端内终止,日志看起来像这样
大约 2 分钟后,执行程序的 stderr 看起来像这样
大约 7 分钟后,我得到
Exception in thread "main" java.lang.OutOfMemoryError: GC overhead limit exceeded
在我的终端中,我必须手动终止 SparkSubmit
进程。然而,大型数据集是从一个仅占用 22 MB 的二进制文件中索引的,并且执行 nodetool status
,我可以看到我的两个 cassandra 节点中只存储了大约 115 MB 的数据。我也尝试在我的数据集上使用 Spark SQL,但也得到了类似的结果。对于 Transformation-Action 程序和使用 Spark 的程序,我的设置哪里出错了,我应该怎么做才能成功处理我的数据集 SQL.
我已经尝试过以下方法
使用-Xms1G -Xmx1G
增加内存,但程序失败,异常提示我应该改为设置spark.executor.memory
,我有
Using spark.cassandra.input.split.size
,它没有说它不是一个有效的选项,类似的选项是 spark.cassandra.input.split.size_in_mb
,我将其设置为 1,但没有效果。
编辑
根据this的回答,我也试过以下方法:
将spark.storage.memoryFraction
设为0
不将 spark.storage.memoryFraction
设置为零并将 persist
与 MEMORY_ONLY
、MEMORY_ONLY_SER
、MEMORY_AND_DISK
和 MEMORY_AND_DISK_SER
一起使用.
版本:
Spark:1.4.0
卡桑德拉:2.1.6
spark-cassandra-连接器:1.4.0-M1
我认为最新的 spark-cassandra-connector 有问题。参数 spark.cassandra.input.split.size_in_mb
应该有默认值 64 MB,在代码中被解释为 64 字节。这样会导致创建的partition过多,spark无法调度。尝试将 conf 值设置为
spark.cassandra.input.split.size_in_mb=67108864
我正在尝试使用 Apache Spark 来处理我的大型(~230k 条目)cassandra 数据集,但我经常 运行 遇到各种错误。但是,当 运行 对数据集 ~200 个条目进行 运行 应用时,我可以成功 运行 应用程序。我有一个包含 3 个节点的 spark 设置,其中有 1 个主节点和 2 个工作节点,这 2 个工作节点还安装了一个 cassandra 集群,其数据索引的复制因子为 2。我的 2 个 spark 工作节点在 Web 界面上显示了 2.4 和 2.8 GB 的内存,并且我在 运行 应用程序时将 spark.executor.memory
设置为 2409,以获得 4.7 GB 的组合内存。这是我的 WebUI 主页
其中一项任务的环境页面
现阶段,我只是尝试使用 spark 处理存储在 cassandra 中的数据。这是我在 Java
中用来执行此操作的基本代码SparkConf conf = new SparkConf(true)
.set("spark.cassandra.connection.host", CASSANDRA_HOST)
.setJars(jars);
SparkContext sc = new SparkContext(HOST, APP_NAME, conf);
SparkContextJavaFunctions context = javaFunctions(sc);
CassandraJavaRDD<CassandraRow> rdd = context.cassandraTable(CASSANDRA_KEYSPACE, CASSANDRA_COLUMN_FAMILY);
System.out.println(rdd.count());
对于一个成功的 运行,在一个小数据集(200 个条目)上,事件界面看起来像这样
但是当我 运行 在大型数据集上做同样的事情时(即我只更改 CASSANDRA_COLUMN_FAMILY
),作业永远不会在终端内终止,日志看起来像这样
大约 2 分钟后,执行程序的 stderr 看起来像这样
大约 7 分钟后,我得到
Exception in thread "main" java.lang.OutOfMemoryError: GC overhead limit exceeded
在我的终端中,我必须手动终止 SparkSubmit
进程。然而,大型数据集是从一个仅占用 22 MB 的二进制文件中索引的,并且执行 nodetool status
,我可以看到我的两个 cassandra 节点中只存储了大约 115 MB 的数据。我也尝试在我的数据集上使用 Spark SQL,但也得到了类似的结果。对于 Transformation-Action 程序和使用 Spark 的程序,我的设置哪里出错了,我应该怎么做才能成功处理我的数据集 SQL.
我已经尝试过以下方法
使用
-Xms1G -Xmx1G
增加内存,但程序失败,异常提示我应该改为设置spark.executor.memory
,我有Using
spark.cassandra.input.split.size
,它没有说它不是一个有效的选项,类似的选项是spark.cassandra.input.split.size_in_mb
,我将其设置为 1,但没有效果。
编辑
根据this的回答,我也试过以下方法:
将
spark.storage.memoryFraction
设为0不将
spark.storage.memoryFraction
设置为零并将persist
与MEMORY_ONLY
、MEMORY_ONLY_SER
、MEMORY_AND_DISK
和MEMORY_AND_DISK_SER
一起使用.
版本:
Spark:1.4.0
卡桑德拉:2.1.6
spark-cassandra-连接器:1.4.0-M1
我认为最新的 spark-cassandra-connector 有问题。参数 spark.cassandra.input.split.size_in_mb
应该有默认值 64 MB,在代码中被解释为 64 字节。这样会导致创建的partition过多,spark无法调度。尝试将 conf 值设置为
spark.cassandra.input.split.size_in_mb=67108864