如何使用 nilearn 和 matplotlib 子图绘制 3D 大脑图像的多个切片

Question

我是编码新手，所以如果我完全错了请告诉我。

我想使用 nilearn 绘制 25 个大脑扫描切片。这 25 个切片应以值 = 2 的步长沿着 z 轴。我想用subplots来用subplots来呈现它们

这是我目前的情况：

cuts = np.arange(-25,25,2)
fig, (axes1,axes2,axes3,axes4,axes5) = plt.subplots(5,1, figsize=(10,10))

for axes in [axes1,axes2,axes3,axes4,axes5]:
    for slc in cuts:
        plotting.plot_stat_map(rsn_four, display_mode='z', axes=axes, cut_coords=[slc], threshold=2)
plt.show()

'rsn_four' 是 BOLD 扫描的 3D Nifti 文件。

Output:

我认为我最大的问题之一是，我不知道如何实现，每个轴我想要 np.arange() 的 5 个值，然后将它带到下一个轴继续计数.

如果我错过了一些信息，请告诉我，这是我第一次 post 来这里！

Answer 1

enumerate built-in 可能有助于从每个图像中仅获取您想要的正确索引

cuts = np.arange(-25,25,2)
fig, (axes1,axes2,axes3,axes4,axes5) = plt.subplots(5,1, figsize=(10,10))

for num, axes in enumerate([axes1,axes2,axes3,axes4,axes5]):
    for slc in cuts[num:num+5]:
        plotting.plot_stat_map(rsn_four, display_mode='z', axes=axes, cut_coords=[slc], threshold=2)
plt.show()

如何使用 nilearn 和 matplotlib 子图绘制 3D 大脑图像的多个切片

How to plot multiple slices of a 3D brain image with nilearn and matplotlib subplots

python

matplotlib

neuroscience

subplot

nilearn