如何计算图像数据集中 RGB 值的 3x3 协方差矩阵？

Question

我需要计算图像数据集中 RGB 值的协方差矩阵，然后对最终结果应用 Cholesky 分解。

RGB 值的协方差矩阵是一个 3x3 矩阵 M，其中 M_(i, i) 是通道 i 的方差，M_(i, j) 是通道 i 和 j 之间的协方差。

最终结果应该是这样的：

([[0.26, 0.09, 0.02],
[0.27, 0.00, -0.05],
[0.27, -0.09, 0.03]])

我更愿意坚持使用 PyTorch 函数，即使 Numpy 有 Cov 函数。

我在这里尝试基于其他 cov 实现和克隆在 PyTorch 中重新创建 numpy Cov 函数：

def pytorch_cov(tensor, tensor2=None, rowvar=True):
    if tensor2 is not None:
        tensor = torch.cat((tensor, tensor2), dim=0)
    tensor = tensor.view(1, -1) if tensor.dim() < 2 else tensor
    tensor = tensor.t() if not rowvar and tensor.size(0) != 1 else tensor
    tensor = tensor - torch.mean(tensor, dim=1, keepdim=True)
    return 1 / (tensor.size(1) - 1) * tensor.mm(tensor.t())

def cov_vec(x):
    c = x.size(0)
    m1 = x - torch.sum(x, dim=[1],keepdims=True)/ c
    out = torch.einsum('ijk,ilk->ijl',m1,m1)  / (c - 1)
    return out

数据集加载是这样的：

dataset = torchvision.datasets.ImageFolder(data_path)
loader = torch.utils.data.DataLoader(dataset)

for images, _ in loader:
    batch_size = images.size(0) 
    ...

目前我只是在试验用 torch.randn(batch_size, 3, height, width) 创建的图像。

编辑：

我正在尝试从 Tensorflow 的 Lucid 中复制矩阵 here, and somewhat explained on distill.pub here。

第二次编辑：

为了使输出类似于示例一，您必须这样做而不是使用 Cholesky：

rgb_cov_tensor = rgb_cov_tensor / len(loader.dataset)
U,S,V = torch.svd(rgb_cov_tensor)
epsilon = 1e-10
svd_sqrt = U @ torch.diag(torch.sqrt(S + epsilon))

生成的矩阵随后可用于执行颜色去相关，这对于可视化特征 (DeepDream) 很有用。我已经在我的项目 here.

中实现了它

Answer 1

这是一个用于计算 3 通道图像上的（无偏）样本协方差矩阵的函数，名为 rgb_cov。 Cholesky 分解很简单 torch.cholesky:

import torch
def rgb_cov(im):
    '''
    Assuming im a torch.Tensor of shape (H,W,3):
    '''
    im_re = im.reshape(-1, 3)
    im_re -= im_re.mean(0, keepdim=True)
    return 1/(im_re.shape[0]-1) * im_re.T @ im_re

#Test:
im = torch.randn(50,50,3)
cov = rgb_cov(im)
L_cholesky = torch.cholesky(cov)

如何计算图像数据集中 RGB 值的 3x3 协方差矩阵？

How to calculate the 3x3 covariance matrix for RGB values across an image dataset?

python

dataset

pytorch

lucid

covariance-matrix