Packrat::restore() 用于系统依赖
Packrat::restore() for system dependencies
我在 Rstudio 的 Windows 机器上开发了一个 shiny-app。现在我需要在 Linux 机器上开发它，稍后需要将它部署到服务器上。由于需要 运行 应用程序跨平台，我正在研究一些环境控制应用程序，这样我就不必手动调整和重新安装所需的包。
我尝试使用 Packrat 来达到这个目的。我在我的 Windows 机器上做了一个快照，将项目复制并粘贴到我的 Ubuntu，在 RStudio 上重新打开项目，安装 Packrat 并自动恢复包 运行。然后我 运行 遇到了一些需要系统依赖的包没有自动安装的问题，例如rgdal 和 jqr。因此，我不得不在终端中手动安装这些系统依赖项（这花了我一段时间，因为其中大约有 10 个需要额外的系统依赖项）。
我想知道是否有更简单的方法来自动处理这个问题。稍后，我将需要与系统管理员一起将应用程序部署到服务器。我想知道 Packrat 是否具有在 Linux machine/server 上自动安装系统依赖项的能力。如果有人以前遇到过这个问题，或者有其他更好的选择，请告诉我！
谢谢！
您好，欢迎来到 Whosebug。
您面临的问题实际上远比您一开始想象的更难解决---部署复杂 R包依赖性跨不同操作系统是一个真正的困难而且，说实话，未解决的问题！
您当然可以使用 packrat 和 renv 作为 R 包依赖项 和特定版本的快照。但这 not 对 system-level dependencies 做任何事情，这只是被视为“给定”。所以不要只是转移到另一个盒子并说“abracadabra”。抱歉！
我们最接近解决这个问题的可能是Docker，您可以在其中创建一个可移植执行单元，可以部署在任何地方Docker 运行：Windows，macOS，不同的 Linux 风格，...因为它对所有内容进行编码。
我在 Rstudio 的 Windows 机器上开发了一个 shiny-app。现在我需要在 Linux 机器上开发它，稍后需要将它部署到服务器上。由于需要 运行 应用程序跨平台，我正在研究一些环境控制应用程序，这样我就不必手动调整和重新安装所需的包。
我尝试使用 Packrat 来达到这个目的。我在我的 Windows 机器上做了一个快照，将项目复制并粘贴到我的 Ubuntu，在 RStudio 上重新打开项目，安装 Packrat 并自动恢复包 运行。然后我 运行 遇到了一些需要系统依赖的包没有自动安装的问题，例如rgdal 和 jqr。因此，我不得不在终端中手动安装这些系统依赖项（这花了我一段时间，因为其中大约有 10 个需要额外的系统依赖项）。
我想知道是否有更简单的方法来自动处理这个问题。稍后，我将需要与系统管理员一起将应用程序部署到服务器。我想知道 Packrat 是否具有在 Linux machine/server 上自动安装系统依赖项的能力。如果有人以前遇到过这个问题，或者有其他更好的选择，请告诉我！
谢谢！
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您当然可以使用 packrat 和 renv 作为 R 包依赖项 和特定版本的快照。但这 not 对 system-level dependencies 做任何事情，这只是被视为“给定”。所以不要只是转移到另一个盒子并说“abracadabra”。抱歉！
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