如何从 Manova 输出中提取 p 值
How to extract p value from Manova output
我正在通过 R 中的 manova 公式测试 Hotelling T^2 测试。我正在测试不同的相同尺寸,因此有多个 Manova table 输出。下面是我如何为整个样本生成 manova
attach(iris)
library(Hotelling)
library(corpcor)
s= iris[1:100,1:5]
input= cbind(s$Sepal.Length,s$Sepal.Width, s$Petal.Length, s$Petal.Width )
m= manova(input~ Species, data = s)
summary(m, "Hotelling-Lawley")
我想知道如何从每个 table 中提取 p 值。我试图跟随但没有这样的运气:
res$"Pr(>F)"
res$p.value
summary(man)[8]
但每个 return NULL
在您的示例中,p
非常小:
summary(m, "Hotelling-Lawley")$stats
Df Hotelling-Lawley approx F num Df den Df Pr(>F)
Species 1 26.33509 625.4583 4 95 2.664857e-67
Residuals 98 NA NA NA NA NA
对于给定的预测变量,p-value 可以被隔离,例如Species
,像这样:
summary(m, "Hotelling-Lawley")$stats["Species", "Pr(>F)"]
[1] 2.664857e-67
文档 here.
我知道这只是 iris
的测试用例,但即便如此:请考虑当 p-value 这么小时,它开始失去作为有效测试统计量的意义。您可以改为选择效果大小的衡量标准,甚至是描述性统计数据来支持您的结果。
我正在通过 R 中的 manova 公式测试 Hotelling T^2 测试。我正在测试不同的相同尺寸,因此有多个 Manova table 输出。下面是我如何为整个样本生成 manova
attach(iris)
library(Hotelling)
library(corpcor)
s= iris[1:100,1:5]
input= cbind(s$Sepal.Length,s$Sepal.Width, s$Petal.Length, s$Petal.Width )
m= manova(input~ Species, data = s)
summary(m, "Hotelling-Lawley")
我想知道如何从每个 table 中提取 p 值。我试图跟随但没有这样的运气:
res$"Pr(>F)"
res$p.value
summary(man)[8]
但每个 return NULL
在您的示例中,p
非常小:
summary(m, "Hotelling-Lawley")$stats
Df Hotelling-Lawley approx F num Df den Df Pr(>F)
Species 1 26.33509 625.4583 4 95 2.664857e-67
Residuals 98 NA NA NA NA NA
对于给定的预测变量,p-value 可以被隔离,例如Species
,像这样:
summary(m, "Hotelling-Lawley")$stats["Species", "Pr(>F)"]
[1] 2.664857e-67
文档 here.
我知道这只是 iris
的测试用例,但即便如此:请考虑当 p-value 这么小时,它开始失去作为有效测试统计量的意义。您可以改为选择效果大小的衡量标准,甚至是描述性统计数据来支持您的结果。