如何标记数据点到一个集群？

Question

我已经在 R markdown 中完成并绘制了 DBSCAN 集群。

这是我目前的代码：

dbscan.8=fpc::dbscan(current.matrix, eps=2, MinPts=log(33359)) #list generated

fviz_cluster(dbscan.8, data=current.matrix, stand=FALSE, ellipse=FALSE, 
             show.clust.cent=FALSE, geom="point", palette="jco", 
             ggtheme=theme_classic()) # Plot the clusters

如何在原始数据框 (current.matrix) 中添加一个新列，其中包含每一行所属的集群？所以它看起来像这样：

谢谢！

Answer 1

使用示例数据集：

library(factoextra)
library(fpc)

dat = data.frame(scale(iris[,-5]))

clus = dbscan(dat,1.5)

集群看起来像这样

viz = fviz_cluster(clus, data=dat, 
stand=FALSE, ellipse=FALSE, show.clust.cent=FALSE, geom="point",
palette="jco")

print(viz)

集群信息已经存储在对象fromm中fviz_cluster:

head(viz$data)
  name         x          y    coord cluster
1    1 -2.257141 -0.4784238 5.323576       1
2    2 -2.074013  0.6718827 4.752956       1
3    3 -2.356335  0.3407664 5.668437       1
4    4 -2.291707  0.5953999 5.606421       1
5    5 -2.381863 -0.6446757 6.088877       1
6    6 -2.068701 -1.4842053 6.482388       1

集群也存储在 dbscan 对象下，如 $clusters 。所以你可以这样做：

dat$cluster = viz$data$cluster

或：

dat$cluster = clus$cluster

如何标记数据点到一个集群？

How to tag data point to a cluster?

r

cluster-analysis

dbscan