如何从另一个 Jupyter 笔记本文件获取 R 代码？

Question

我刚开始使用带有 R 内核 的 Jupyter notebook。

我在两个文件 Settings.ipynb 和 Main_data.ipynb 中编写了 R 代码。

我的 Settings.ipynb 文件有很多细节。我在下面显示示例详细信息

Schema = "dist"
resultsSchema = "results"
sourceName = "hos"
dbms = "postgresql" #Should be "sql server", "oracle", "postgresql" or "redshift"

user <- "hos"
pw <- "hos"
server <- "localhost/hos"
port <- "9763"

我想在 Main_data 代码文件中获取 Settings 文件。

当我使用R studio时，很简单，因为我只使用下面的

 source('Settings.R')

但是现在在 Main_data 带有 R 内核的 Jupyter Notebook 中，当我编写下面的代码时

 source('Settings.R')  # settings file is in same directory as main_data file

我收到以下错误

Error in source("Settings.R"): Settings.R:2:11: unexpected '['
1: {
2:  "cells": [
             ^
Traceback:

1. source("Settings.R")

当我尝试以下操作时，出现另一个错误，如下所示

source('Settings.ipynb')

Error in source("Settings.ipynb"): Settings.ipynb:2:11: unexpected '['
1: {
2:  "cells": [
             ^
Traceback:

1. source("Settings.ipynb")

如何获取 R code 以及保存它的正确方法（.ipynb 或 .R 在 jupyter notebook（使用 R 内核）中的格式）。你能帮我解决这个问题吗？

更新截图

Answer 1

我们可以在相同的工作目录（或不同的）中创建一个 .INI 文件并使用 ConfigParser 来解析所有元素。 .INI 文件将是

Settings.INI

[settings-info]
schema = dist
resultsSchema = results
sourceName = hos
dbms = postgresql

user = hos
pw = hos
server = localhost/hos

然后，我们初始化一个解析器object，从文件中读取内容。我们可以有多个子标题（这里只有 'settings-info'）并使用 [[ 或 $

提取组件

library(ConfigParser)
props <- ConfigParser$new()
props <- props$read("Settings.INI")$data
props[["settings-info"]]$schema

来自 Jupyter notebook

'Settings.INI' 文件

Answer 2

尝试以 .R 格式保存 Jupyter notebook 文件将不起作用，因为格式有点混乱（由于存在 { "cells" : [...." 之类的东西）。您可以通过打开来验证您在 Jupyter Notebook 中的 .R 文件。

但是，您可以使用 vim editor/R 工作室创建 .R 文件。这将使您能够按原样获得内容，而不会出现任何格式问题，例如 { "cells" : [....".

稍后从另一个 jupyter notebook，您可以 import/source 使用 vim editor/R studio 创建的 .R 文件。这为我解决了问题。

总而言之，不要使用 jupyter notebook 创建 .R 文件并使用另一个 jupyter notebook 文件获取它们。

如何从另一个 Jupyter 笔记本文件获取 R 代码？

How to source R code from another Jupyter notebook file?

r

jupyter

jupyter-notebook

jupyter-irkernel

jupyter-lab