如何计算每行的标准偏差?

How to calculate standard deviation per row?

我正在尝试计算每行的标准偏差

输入示例(values_for_all):

1  0.35 0.35 4.33 0.09 4.17 0.16 9.90 15.25 0.16 2.38 2.55 8.14 0.16 NA 0.16
2  8.75 3.22 7.34 0.56 2.43 0.23 1.20 8.45 1.26 NA NA 1.24 0.16 2.34 0.36

代码:

values_for_all[values_for_all == ''] <- NA
values_for_all[] <- lapply(values_for_all, as.numeric)
values_mean <- rowMeans(values_for_all, na.rm=TRUE) 

#calculating standard deviation per row 
SD <- rowSds(values_for_all, na.rm=TRUE)
SD

第一部分 (values_mean) 完美运行。不幸的是,带有 SD 的部分没有。

您可以使用 apply:

apply(df, 1, sd)

apply lets you apply a function to all rows of your data:

apply(values_for_all, 1, sd, na.rm = TRUE)

要计算每列的标准偏差,请将 1 替换为 2

您正在使用 matrixStats,这意味着该函数应该应用于矩阵。因此,将 as.matrix 包裹在您的数据框周围。

matrixStats::rowSds(as.matrix(dat), na.rm=TRUE)
# [1] 4.515403 3.050903