Spark saveAsTable 位于 s3 存储桶的根本原因 NullPointerException

Question

我正在使用 Spark 3.0.1，我的分区 table 存储在 s3 中。请在此处找到问题的描述。

创建Table

Create table root_table_test_spark_3_0_1 (
    id string,
    name string
)
USING PARQUET
PARTITIONED BY (id)
LOCATION  's3a://MY_BUCKET_NAME/'

导致第二个 NullPointerException 的代码运行

Seq(MinimalObject("id_1", "name_1"), MinimalObject("id_2", "name_2"))
      .toDS()
      .write
      .partitionBy("id")
      .mode(SaveMode.Append)
      .saveAsTable("root_table_test_spark_3_0_1")

当 Hive Metastore 为空时，一切正常，但是当 spark 尝试在 InsertIntoHadoopFsRelationCommand 阶段执行 getCustomPartitionLocations 时，问题就出现了。（以第二个运行为例）

实际上它调用了以下方法：from (org.apache.hadoop.fs.Path)

/** Adds a suffix to the final name in the path.*/
public Path suffix(String suffix) {
    return new Path(getParent(), getName()+suffix);
}

但是当我们处于根目录时，getParent() 将 return 为 null，从而导致 NullPointerException。我目前考虑的唯一选择是覆盖此方法来执行类似的操作：

/** Adds a suffix to the final name in the path.*/
public Path suffix(String suffix) {
    return (isRoot()) ? new Path(uri.getScheme(), uri.getAuthority(), suffix) : new Path(getParent(), getName()+suffix);
}

有人在 spark hive table 的 LOCATION 处于根级别时遇到问题吗？任何解决方法？有没有打开任何已知问题？

我的运行时不允许我覆盖路径 class 并修复 suffix 方法，我无法从存储桶的根移动我的数据，因为它已经存在 2 年了。

出现此问题是因为我正在从 Spark 2.1.0 迁移到 Spark 3.0.1，并且检查自定义分区的行为出现在 Spark 2.2.0 (https://github.com/apache/spark/pull/16460)

整个上下文有助于理解问题，但基本上您可以轻松重现它

val path: Path = new Path("s3a://MY_BUCKET_NAME/")
println(path.suffix("/id=id"))

仅供参考。 hadoop-common 版本是 2.7.4，请在这里找到完整的堆栈跟踪

NullPointerException
at org.apache.hadoop.fs.Path.<init>(Path.java:104)
    at org.apache.hadoop.fs.Path.<init>(Path.java:93)
    at org.apache.hadoop.fs.Path.suffix(Path.java:361)
    at org.apache.spark.sql.execution.datasources.InsertIntoHadoopFsRelationCommand.$anonfun$getCustomPartitionLocations(InsertIntoHadoopFsRelationCommand.scala:262)
    at scala.collection.TraversableLike.$anonfun$flatMap(TraversableLike.scala:245)
    at scala.collection.mutable.ResizableArray.foreach(ResizableArray.scala:62)
    at scala.collection.mutable.ResizableArray.foreach$(ResizableArray.scala:55)
    at scala.collection.mutable.ArrayBuffer.foreach(ArrayBuffer.scala:49)
    at scala.collection.TraversableLike.flatMap(TraversableLike.scala:245)
    at scala.collection.TraversableLike.flatMap$(TraversableLike.scala:242)
    at scala.collection.AbstractTraversable.flatMap(Traversable.scala:108)
    at org.apache.spark.sql.execution.datasources.InsertIntoHadoopFsRelationCommand.getCustomPartitionLocations(InsertIntoHadoopFsRelationCommand.scala:260)
    at org.apache.spark.sql.execution.datasources.InsertIntoHadoopFsRelationCommand.run(InsertIntoHadoopFsRelationCommand.scala:107)
    at org.apache.spark.sql.execution.datasources.DataSource.writeAndRead(DataSource.scala:575)
    at org.apache.spark.sql.execution.command.CreateDataSourceTableAsSelectCommand.saveDataIntoTable(createDataSourceTables.scala:218)
    at org.apache.spark.sql.execution.command.CreateDataSourceTableAsSelectCommand.run(createDataSourceTables.scala:166)

谢谢

Answer 1

看起来像是 spark 代码调用 Path.suffix("something) 的情况，因为根路径没有父路径，所以触发了 NPE

长期修复

在 issues.apache.org 上针对 HADOOP 提交 JIRA；提供带有修复后缀（）测试的补丁，以便在根路径上调用时正确降级。最适合所有人
不要将根路径用作 table 的目标。
这两个都做

选项 #2 应该避免关于 table 是如何 created/committed 等的其他意外......一些代码可能会失败，因为试图删除路径的根（这里是 s3a： //some-bucket") 不会删除根，对吗？

换句话说：根目录到处都有“奇怪”的语义；大多数时候你不会在本地 FS 上注意到这一点，因为你从不尝试使用 / 作为工作目的地，感到惊讶的是 rm -rf / 与 rm -rf /subdir 等不同。Spark，Hive 等从来没有写成使用 / 作为工作的目的地，所以你会看到失败。

Spark saveAsTable 位于 s3 存储桶的根本原因 NullPointerException

Spark saveAsTable with location at s3 bucket's root cause NullPointerException

apache-spark

hadoop

hive

hadoop2

spark-hive