从 Rcpp 调用 stats::optim 如何导致内存泄漏?
How calling stats::optim from Rcpp causes memory leak?
在我的部分代码中,我需要优化 Rcpp 中的一个函数(我按照这里的第二个答案 Applying the optim function in R in C++ with Rcpp)。但是,我发现该函数会泄漏内存(很少,但如果它是重复 运行 模拟的一部分,它就会变得复杂)。我创建了一个最小的可重现示例,但我不知道泄漏 originate/how 在哪里处理它。我可以寻求有关处理此问题的指导吗?
Rcpp 代码:
#include <Rcpp.h>
using namespace Rcpp;
double objective_function(double x){
double obj = .666 - x;
return pow(obj, 2);
}
// [[Rcpp::export(leak)]]
double leak(double a, double b){
// Extract R's optim function
Rcpp::Environment stats("package:stats");
Rcpp::Function optim = stats["optim"];
// Call the optim function from R in C++
Rcpp::List opt_results = optim(Rcpp::_["par"] = .5,
Rcpp::_["fn"] = Rcpp::InternalFunction(&objective_function),
Rcpp::_["method"] = "Brent",
Rcpp::_["lower"] = a,
Rcpp::_["upper"] = b);
// Extract out the estimated parameter values
double mu = opt_results[0];
// Return estimated values
return mu;
}
R代码:
repeat{
leak(0, 1)
}
当我查看我的任务管理器时,Rstudio R Session 下的 RAM 使用量正在稳步增加(如果我使用任何其他仅 returns 值的函数,则不会发生这种情况)。
使用 macOS + Instruments 检漏仪,似乎 Rcpp::InternalFunction
正在泄漏:
这将我们指向此处的代码:
请注意,我们正在使用 new
分配对象,但我们也告诉 XPtr
not 注册删除终结器:
我不是很清楚为什么我们这样做,但我认为它解释了行为。可能值 filing an issue.
在我的部分代码中,我需要优化 Rcpp 中的一个函数(我按照这里的第二个答案 Applying the optim function in R in C++ with Rcpp)。但是,我发现该函数会泄漏内存(很少,但如果它是重复 运行 模拟的一部分,它就会变得复杂)。我创建了一个最小的可重现示例,但我不知道泄漏 originate/how 在哪里处理它。我可以寻求有关处理此问题的指导吗?
Rcpp 代码:
#include <Rcpp.h>
using namespace Rcpp;
double objective_function(double x){
double obj = .666 - x;
return pow(obj, 2);
}
// [[Rcpp::export(leak)]]
double leak(double a, double b){
// Extract R's optim function
Rcpp::Environment stats("package:stats");
Rcpp::Function optim = stats["optim"];
// Call the optim function from R in C++
Rcpp::List opt_results = optim(Rcpp::_["par"] = .5,
Rcpp::_["fn"] = Rcpp::InternalFunction(&objective_function),
Rcpp::_["method"] = "Brent",
Rcpp::_["lower"] = a,
Rcpp::_["upper"] = b);
// Extract out the estimated parameter values
double mu = opt_results[0];
// Return estimated values
return mu;
}
R代码:
repeat{
leak(0, 1)
}
当我查看我的任务管理器时,Rstudio R Session 下的 RAM 使用量正在稳步增加(如果我使用任何其他仅 returns 值的函数,则不会发生这种情况)。
使用 macOS + Instruments 检漏仪,似乎 Rcpp::InternalFunction
正在泄漏:
这将我们指向此处的代码:
请注意,我们正在使用 new
分配对象,但我们也告诉 XPtr
not 注册删除终结器:
我不是很清楚为什么我们这样做,但我认为它解释了行为。可能值 filing an issue.