MRREL 上的 NIH UMLS 数据模型

NIH UMLS Data Model on MRREL

我正在 MySQL 的本地副本中使用统一医学语言系统 (UMLS) 数据库。我目前正试图通过此网页了解数据结构:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK9685/

我正在尝试识别 CUI2 中的概念。但是,我对这个结果感到困惑:

SELECT y.* FROM mrrel r INNER JOIN mrconso y ON r.cui2 = y.CUI;

恰好有 1 个结果。与其胡思乱想——是我的 sql 吗?是桌子上的错误吗?我是否误解了模式?——我非常感谢 UMLS 社区的一些反馈。我如何正确地 link MRREL.cui2 到数据库中的其他表?是否在某处发布了完整的数据模型?

谢谢!

布莱恩,

我对您创建子集的方式一无所知,因此我稍微修改了您的查询,然后 运行 它针对 2015AA 版本的完整 Metathesaurus 子集。 SELECT count(DISTINCT y.cui) FROM mrrel r INNER JOIN mrconso y ON r.cui2 = y.CUI ; 我找回了 3074046 个独特的 CUI。也许您可以将您的 mmsys.log 文件发送给我以确保您的子集正确完成?此外,您还可以使用几个 ER 图和 sample queries on our website 来帮助理解 RRF 数据模型。另外,您的 MRREL table?

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