如何使用 tidyverse 工具将矩阵读入 R？

Question

你能帮帮我吗？

我经常需要将 关联矩阵 (AxB) 读入 R 格式为 TXT 文件。它们看起来像这样：

matrix <- matrix(round(runif(50, 0, 100),0), 5, 10)

我通常的解决方案涉及基础的 read.delim 和 as.matrix:

as.matrix(read.delim("matrix.txt", row.names = 1))

文件被读取并转换为matrixclass，因此可以进行适当的分析。

但是，我希望也能够使用 tidyverse 的 read_delim 读取矩阵文件，因此对于大型矩阵或大型矩阵的数量。我试过这个：

as.matrix(read_delim("matrix.txt", delim = "/t"))

但是数据以一种非常奇怪的格式被扰乱，信息丢失了。有没有一种方法可以使用 tidyverse 工具阅读和处理发生率 matrices？

谢谢！

Answer 1

在R中，需要使用反斜杠来表示特殊字符和转义字符。

尝试

as.matrix(read_delim("matrix.txt", delim = "\t"))

read_delim 函数没有 row.names 选项，因此您必须转换数据以将行名作为行名（而不是第一列）。您应该在转换为矩阵之前执行此操作。

library(tidyverse)
matrix <- read_delim("matrix.txt", delim = "\t") %>%
  column_to_rownames(first_column) %>%
  as.matrix()

Answer 2

试试这个

as.matrix(read_delim("matrix.txt", delim = "\t", col_names = F))

How to read a matrix into R using tidyverse tools?