R 不从 SQLite 中读取表

Question

你能帮帮我吗？告诉我错误在哪里。我正在尝试将 tables 从 SQLite 拉到 R。开始时，他没有读取 DB，但后来打开它，但他仍然没有看到 table。

    > library('RSQLite')
    > require(SQLite)
    Loading required package: SQLite
    Warning message:
    In library(package, lib.loc = lib.loc, character.only = TRUE, logical.return = TRUE,  :
      there is no package called ‘SQLite’
    > drv <- dbDriver("SQLite") 
    > require('RSQLite')
    > dvr <- dbDriver('RSQLite')
    Error: Couldn't find driver RSQLite. Looked in:
    * global namespace
    * in package called RSQLite
    * in package called RRSQLite
    > View(drv)
    > con <- dbConnect(drv, dbname= 'test.db')
    > dbListTables(con)
    character(0)
    > dbReadTable(con, 'name')
    Error: no such table: name

Answer 1

首先，问题中的代码可以减少很多行，因为其中大部分是“试图找到包”。我将处理这个相关的代码子集：

con <- dbConnect(drv, dbname= 'test.db')
dbListTables(con)
# character(0)
dbReadTable(con, 'name')
# Error: no such table: name

虽然输出本身相当 self-explanatory（character(0) 表示 database/file 中没有用户表），但“为什么”的原因可能不直观。虽然我们不确定，但我认为这会发生在你身上有一个非常可信的原因：

该文件不在 R 的当前工作目录中。

我认为知道 SQLite 是唯一的“数据库类型”（好吧，duckdb 也是...）是很有启发性的，当您连接时，如果该文件尚不存在，将为您创建它作为一个空数据库。更令人恼火的是，它是完全默默地做这件事的；事后看来，特别是对于该软件包的新用户而言，为 RSQLite 的 dbConnect 实现提供一个 create=FALSE 选项可能会提供一些信息，该选项会在以下情况下错误（或至少警告）用户这是一个新文件，因此不存在表格。

事后看来是20/20，如果你在file-existence 尝试打开它之前检查过它，你可能会发现它不存在，建议你应该先找到它。例如，这可能是你会看到的（但现在不会看到，原因我稍后会说）：

file.exists("test.db") # [1] FALSE

它现在可能 return TRUE 的原因是，通过连接到 non-existent 文件，正如我之前所说，它默认创建一个新的（空）文件。但是，如果您对该数据库连接没有做任何其他事情（特别是将任何数据插入任何表），那么您可能会发现这是真的：

file.info("test.db") # size isdir mode mtime ctime atime # test.db 0 FALSE 666 2020-11-05 15:53:21 2020-11-05 15:53:21 2020-11-05 15:53:21 # exe # test.db no

具体来说，size为0，表示该文件为空。（空的 SQLite 数据库是真正的 zero-length 文件，尽管当你添加任何东西时它会为标准的 SQLite 管理表等增长很多。）

最终，这种情况下的问题（我猜）是您正在一个目录中查看 "test.db"（或从浏览器下载目录复制到那里），但您的 R 是运行在不同的目录中。虽然这个答案不是解决有关工作目录问题的最佳位置，但您可以通过
找到一些信息
getwd() # [1] "C:/Users/r2/Whosebug"

也许会尝试将其与您保存 "test.db" 的实际目录相关联。例如，可以使用以下之一：

con <- dbConnect(drv, dbname= 'path/to/test.db') # relative to this directory con <- dbConnect(drv, dbname= '../../path/to/test.db') # also relative, but not "below" con <- dbConnect(drv, dbname= '/path/to/test.db') # absolute path to that file

R 不从 SQLite 中读取表

R does not read tables from SQLite

database

sqlite

r

rsqlite